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虚谦

至尊木虫 (正式写手)

[交流] 【讨论】autodock时出现autodock4: can't create log file! 已有3人参与

本人正在学习autodock4的使用,使用的是windows版本,装在win7机器,在重复例子1hsg的过程中出现小问题,autogrid能够成功结束,在进行到autodock时出现
autodock4: can't create log file E:\caculation\1hsg\indË.dlg
autodock4: Unsuccessful Completion.
不知道是什么原因导致,在网上查了一些资料,有说在cmd里运行autodock4.exe  -p “E:/calculation/1hsg/ind.dpf” -l “E:/calculation/1hsg/ind.dlg”
也有的说在cmd里进入存文件的文件夹位置运行autodock4.exe  -p ind.dpf -l ind.dlg&,网上说这两种方法都会运行成功
但在我的机器上就不好使
在本论坛上看见有朋友说在开始启动autodock时不要选择autodock3,autodock4.0和autodock4.2
说是版本的冲突,这样就可以正常运行
同样在我的机器上不好使
网上有人说需要将file=》preferences=》modify defaults中的默认文件夹改为存放对接文件的文件夹
可是出现同样的问题


在这里我希望把我遇到的问题及我能查到的解决方法都写出来,为了以后的朋友学习autodock时少走一些弯路
也希望高手在这能帮我解决一下这个问题!大家都是从不会到会的,请不要觉得我的问题简单,可能您的一句话,
就会使我们受益匪浅!我先在这谢谢了!
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大家都说我是个好人,其实,我也是这么想的~!
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icedreamer

新虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
御剑江湖(金币+4): 谢谢 2011-07-12 17:15:06
Autogrid时好像少了*.A.map 和*.NA.map文件吧,grid时MAP类型选择LIGAND,试试,如果还是不行,可以直接在MAP类型中输入A NA。
貌似ADT对win7兼容不好~这个问题很多人都出现过~暂时没有好的解决办法,推荐换个系统XP或者LINUX
2楼2011-07-12 11:23:57
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chemozhang

木虫 (正式写手)

帖子真精彩!
已经收录到淘贴专辑《分子对接问题锦集》
故地如重游月圆更寂寞
3楼2011-09-05 19:07:29
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jathoncheng

新虫 (初入文坛)

★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
zh1987hs: 金币+3, 谢谢 2012-03-17 21:58:00
引用回帖:
2152386楼: Originally posted by 虚谦 at 2010-11-17 07:42:10:
本人正在学习autodock4的使用,使用的是windows版本,装在win7机器,在重复例子1hsg的过程中出现小问题,autogrid能够成功结束,在进行到autodock时出现
autodock4: can't create log file E:\caculation\1hsg\i ...

正确答案是:

你所有用于dock的文件需要放在一个文件夹里,然后设置权限, 那个error mainly due to the patial-right, 默认目录可以在autodock的设置里改。

我遭遇过同样问题,以解决。
4楼2012-03-17 12:44:43
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therotyonth

金虫 (正式写手)

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
这个,我现在遇到了相同的问题呀!
5楼2013-10-10 17:40:09
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