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piaoxue001

木虫 (正式写手)

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[交流] 【求助】用vasp搜寻过渡态的请进

VASPer：
      最近学习了一下，vasp搜寻过渡态。
      也是边看边思考我的体系方法的选择及文件的设置。
      很遗憾，依然有一些问题亟待解决？
      请有经验的各位朋友帮忙：

      （1）vasp搜寻过渡态：有人说要装vasp TST tools？是不是编译好的vasp不能跑过渡态？
         （2）关于方法的选择：看到有的文献用NEB方法，请问团簇的表面小分子的吸附用什么方法？能不能推荐几篇文献？我今天查了一篇，是用dmol搜寻的过渡态
         （3）关于vasp搜过渡态所需的文件。
      有人说需要 INCAR POSCAR POTCAR ｛nodelist （应该是KPOINTS吧。昨天看有的认识这样说的）｝
      另外初始和末态的poscar和优化用的POSCAR形式是不是一样，因为没有例子，所以问的详细一点。
         （4）最重要的是INCAR文件的设置，大家参考的是哪方面的资料呢？
         请问IOPT是否在这里设置。看到有人给的INCAR文件是参考vasp TST tools网站的，有人提出按官方网设置，但是官方网没有关于TST的说明。
         （5）

[ Last edited by piaoxue001 on 2010-11-15 at 08:47 ]

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1楼 2010-11-14 15:31:03

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zh11111

银虫 (正式写手)

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引用回帖:

7楼: Originally posted by cenwanglai at 2010-11-17 13:08:39
VASP自己是有过渡态算法的，就是NEB.这个效果怎么样呢？不清楚。
vtstool的是climbing NEB ，这个需要下载他们网站上的代码和vasp原来的代码一起重新编译。这个vtstool的官方网站上有详细说明，安装和参数设置都有 ...

您好我想请教一下：我研究的是一个A+B生成AB的反应，A分子掺进B结构中同时改变B原有的结构。要研究过渡态就要确定初始与最终的结构。现A,B,AB的初始结构都已优化，接下来要做的就是将A分子放到B结构中优化，使得与最终结构AB对应。那么问题是，比如初始状态的B结构是四方相7 4 15，最终结构是四方相8 8 13，那我该怎么优化初始结构使得初始与终止的晶胞参数相一致呢（换句话说，初始结构与最终结构晶胞参数不同能否研究过渡态）？