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glannee

铁杆木虫 (正式写手)


[交流] 【求助/交流】急!酿酒酵母破壁及SDS-PAGE电泳问题

本人实验的宿主菌是一株工厂中正在使用的工业酿酒酵母。

前期是构建载体、连接启动子和目的基因等工作,不再赘述。现在将目的基因整合入酿酒酵母染色体,提取20个转化子基因组DNA进行PCR,可以P出目的基因条带(原始菌未P出)。但是这些转化子并不表达目的基因的特性(利用木糖产酒精)。由于这些基因表达产物为胞内酶,所以想通过细胞破壁、蛋白电泳直观检测目的基因是否表达。

SDS-PAGE蛋白电泳时,分别以2个基因工程菌做阳性对照、以这个原始宿主菌作阴性对照,试过不同的上样量(最大达到60μL),考马斯亮蓝染色,但是跑出的条带都很淡很淡,无法作出比较和判断。
跑蛋白电泳前,使用过超声、玻璃珠涡旋、反复冻融(液氮--65℃水浴)等方法进行酵母菌破壁,但显微镜观察,只有30%左右原生质体;也是用过蜗牛酶,破壁率在50%左右。

实验室其他同学的蛋白电泳都是检测胞外酶,直接用发酵液上清上样即可,跑出的条带清晰、美观。查资料试过一些方法,但都无效。请教各位做过酿酒酵母的老师同学,这个蛋白电泳的问题是不是出在细胞破碎上?针对酿酒酵母细胞,有什么好的破碎/破壁方法,同时不影响蛋白质和DNA的后续检测?还有什么注意事项?

现在急需这个蛋白电泳的结果验证我前期实验。恳请大家帮助!

[ Last edited by glannee on 2010-11-13 at 23:21 ]
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glannee(金币+1):谢谢参与
glannee(金币+1): 2010-11-13 23:21:53
液氮研磨吧,以前跑PAGE直接用玻璃砂(sigma)漩涡也能跑。
不过你要是用的是组成型的启动子的话,表达量不会很高,跑PAGE应该很难看到目的条带吧。
2楼2010-11-13 23:13:48
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glannee

铁杆木虫 (正式写手)



dhd997(金币+1):鼓励回帖交流。 2010-11-14 08:41:56
谢谢,就液氮研磨没试过,我这两天试试用石英砂砂漩涡再跑。
我用的是组成型的强启动子,整合后目的基因拷贝数应该在100左右,如果表达,表达量应该不会太低。而且转化子在木糖筛选平板上能生长,就是不利用木糖发酵酒精。
问题是,如果只是目的基因跑PAGE很难看到目的条带,那阳性对照和阴性对照中,正常表达的原有基因,也应该有清晰的条带出来的吧?而结果是每条泳道中条带很淡,无法做任何比较。所以现在分析不出问题出在哪里

[ Last edited by glannee on 2010-11-13 at 23:34 ]
3楼2010-11-13 23:26:35
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gao-feng

铁杆木虫 (著名写手)



glannee(金币+1):谢谢参与
直接用液氮研磨,反复几次会好一些。
4楼2010-11-13 23:44:23
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scelab

荣誉版主 (文坛精英)



glannee(金币+1):谢谢参与
帮顶,希望问题能够快点解决
5楼2010-11-13 23:54:33
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hustzjwf

铁杆木虫 (著名写手)



glannee(金币+1):谢谢参与
帮楼主顶下。
6楼2010-11-14 00:21:27
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dispy

金虫 (小有名气)



glannee(金币+1):谢谢参与
用液氮试试
7楼2010-11-14 13:35:32
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chunqizzm

银虫 (小有名气)



glannee(金币+1): 谢谢参与
引用回帖:
2047425楼: Originally posted by glannee at 2010-11-13 22:56:25:
本人实验的宿主菌是一株工厂中正在使用的工业酿酒酵母。

前期是构建载体、连接启动子和目的基因等工作,不再赘述。现在将目的基因整合入酿酒酵母染色体,提取20个转化子基因组DNA进行PCR,可以P出目的基因条带 ...

现在才回复是不是太晚了!呵呵!
电泳方面有没有考虑让样品浓缩后再上样啊?比如浓缩100倍。
8楼2012-03-19 22:10:49
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kedaxiaoyu

木虫 (职业作家)



glannee(金币+1): 谢谢参与
液氮研磨,跑电泳时样品先浓缩,浓缩倍数看情况而定。
9楼2012-03-20 15:52:13
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yaolinlshang

金虫 (正式写手)



glannee(金币+1): 谢谢参与
你好,我也是做酵母木糖产醇的。可是你这个问题我还没有接触到,我的QQ309075230,很乐意和你一起探讨相关问题。
10楼2012-05-26 09:55:25
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酿酒酵母

铜虫 (初入文坛)



glannee(金币+1): 谢谢参与
我想问一下,液氮研磨后的后续操作是什么?
11楼2012-08-09 18:19:12
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肖-洋

新虫 (初入文坛)



glannee(金币+1): 谢谢参与
想问问楼主怎么检测破壁率?通过显微镜观察吗?希望楼主指教,谢谢
12楼2013-06-29 17:14:29
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yage2014

新虫 (初入文坛)


glannee(金币+1): 谢谢参与
本帖内容被屏蔽

13楼2014-04-26 16:38:39
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Neo2000

木虫 (著名写手)



glannee(金币+1): 谢谢参与
你如果是要跑page的话,建议用宝生物的酵母蛋白提取试剂,可能会事半功倍

[ 发自小木虫客户端 ]
14楼2014-04-26 20:08:17
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冰艺于欣然

新虫 (小有名气)



glannee(金币+1): 谢谢参与
引用回帖:
2楼: Originally posted by susizheng at 2010-11-13 23:13:48
液氮研磨吧,以前跑PAGE直接用玻璃砂(sigma)漩涡也能跑。
不过你要是用的是组成型的启动子的话,表达量不会很高,跑PAGE应该很难看到目的条带吧。

我试了超声,超了很久很久都没有明显效果,液氮研磨简单粗暴有效但是损失量太大,我需要测生物大分子,需要定量。还试过高压匀质机,也没有明显效果
求比较好的不影响定量分析的方法,又不能引入蛋白,所以裂解酶、破壁酶什么的都不能用啊
15楼2014-11-24 09:41:08
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