应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】Gaussian SCRF 优化求助
51/1返回列表
查看: 2352  |  回复: 7
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

z5476t4508

新虫 (正式写手)

[交流] 【求助】Gaussian SCRF 优化求助

大家好，我最近在溶剂环境下做了一个优化计算，体系有140个原子，可是没有成功，搞了半天也没明白怎么回事，麻烦大家指点下原因，谢啦

输入文件：
******************************************
%chk=prod20ns.chk
%mem=480MW
%nproc=8
Will use up to    8 processors via shared memory.
----------------------------
#p b3lyp/6-31g* opt scrf=pcm
----------------------------

报错是：
Leave Link  103 at Fri Nov 12 05:22:00 2010, MaxMem=  503316480 cpu:      75.1
(Enter /apps/g03/l202.exe)
Small interatomic distances encountered:
     2    1

     3    1

     3    2

     4    1

     4    2

     4    3

     5    1

     5    2

     5    3

     5    4

     6    1

     6    2

     6    3

     6    4

     6    5
     7    1

     7    2

     7    3

     7    4

     7    5
Problem with the distance matrix.
Error termination via Lnk1e in /apps/g03/l202.exe at Fri Nov 12 05:22:02 2010.
Job cpu time: 12 days  7 hours 53 minutes  2.1 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=   6284 Int=      0 D2E=      0 Chk=     96 Scr=      1
                                                                                                                                                               40570,2       Bot
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2010-11-12 16:42:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ykwang

金虫 (正式写手)
★
heyo_123(金币+1):鼓励交流！ 2010-11-12 20:15:58
z5476t4508(金币+1):谢谢 2010-11-12 22:22:23
主要原因是初始结构不合理，某些原子之间的距离太近，导致按PCM缺省的联合原子模型计算分子溶剂化表面时出现无法闭合的情况。改进初始结构是避免这一错误的关键（尽管并不总能奏效）。
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2010-11-12 17:33:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

manson1998

金虫 (著名写手)
★
heyo_123(金币+1):鼓励交流！！ 2010-11-12 20:15:48
z5476t4508(金币+1):谢谢 2010-11-12 22:22:09
计算量很大啊 一可能你的结构有问题，二 去手册上看看PCM的说明吧
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2010-11-12 17:00:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hliu

银虫 (初入文坛)
heyo_123:可以！ 2010-11-12 20:16:04
z5476t4508(金币+1):谢谢 我试试 2010-11-12 22:23:30
能不能在气相下先优化一下，再加溶剂条件
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2010-11-12 18:04:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

boylc789

木虫 (著名写手)
应该是初始结构不合理，某些原子靠的太近
赞一下 回复此楼
5楼2010-11-12 20:43:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的？ +12 爱看书的可乐 2026-08-26 14/700 2026-08-26 13:50 by coolysnow
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +26 yaoyewhu2008 2026-08-20 28/1400 2026-08-26 13:49 by zzuzxg
[基金申请] 怎么查啊 +4 huang1991js 2026-08-26 4/200 2026-08-26 11:26 by panjy.cn
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 国际合作可查了，中了面上 +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +6 process2012 2026-08-23 8/400 2026-08-26 11:03 by zjlp
[基金申请] 今天务委会开完了，明天出结果吗 +19 angus9576 2026-08-25 23/1150 2026-08-26 10:03 by zp519
[职场人生] 学生撞见辅导员送外卖，第二天全班都沉默了 +3 鲸鱼融金_浙江_� 2026-08-22 3/150 2026-08-26 09:01 by zzuzxg
[基金申请] 出来了 +8 trojank 2026-08-26 8/400 2026-08-26 09:00 by gxc
[基金申请] 国合现在查不到了吗？ +10 chengyan1220 2026-08-24 20/1000 2026-08-26 08:57 by peasantsprig
[基金申请] 牛来！米来！面来！ +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件，有关系吗？ +24 木水思豆 2026-08-25 27/1350 2026-08-26 08:26 by yanchen918
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +21 羊腰板 2026-08-21 24/1200 2026-08-26 07:20 by finnigan
[基金申请] 明天应该可查了！？ +6 chengyan1220 2026-08-23 6/300 2026-08-25 19:45 by zfd97
[基金申请] 今日不放榜？网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +17 医学老男孩 2026-08-20 22/1100 2026-08-25 15:36 by 医学老男孩
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑，不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
[基金申请] 人气不行了 +11 fansofjerry 2026-08-21 11/550 2026-08-25 11:04 by 孤独的英雄6
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +13 kulium 2026-08-21 16/800 2026-08-24 16:27 by superceng
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧？ +4 哈哈蛤？ 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭