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Wendydudu

木虫 (小有名气)


[交流] 【求助】请教分子动力学模拟软件选择

新手,从零开始学习分子动力学模拟。
打算做离子导体电导率的计算,也就是要算方均位移。除此之外,材料的应力性能,尤其是热应力性能是否能够计算出?
正在学习了解lammps,据称其计算能力强大,前后处理稍弱,如果用lammps大量的数据是如何处理的?
另外MS的discover有什么特点?
其他的分子动力学模拟软件有哪些?各有什么特点?
最后,是否能够通过分子动力学计算反应的活化能垒?
新人问题问题比较多,还望大家不吝赐教。感激不尽。

问题太多,能帮忙回答一条也是行。

[ Last edited by Wendydudu on 2010-11-10 at 15:33 ]
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Wendydudu

木虫 (小有名气)


引用回帖:
Originally posted by yongma2008 at 2010-12-25 21:03:12:
gromacs也行。
http://www.gromacs.org/

gromacs也是适用于生物大分子。
9楼2011-03-15 21:20:05
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xianggui7895

银虫 (小有名气)


★ ★
mingdong(金币+2):感谢交流! 2010-11-13 13:29:43
Wendydudu(金币+5):谢谢你的帮助。不打算进入到量子力学领域,所以不打算通过密度泛函计算势函数,至少目前是这样的。能否再问下dlpoly大概是什么样的,有些什么特点? 2010-11-15 09:15:03
我也做过一段是的md计算,用的是cpmd,可以从密度泛函计算作用势,如果你的体系没有合适的势函数,可以考虑这个。经典md的话,lammps和dlpoly是用的比较多的,discover功能肯定没有多强大,只是前后处理比较方便
2楼2010-11-12 22:11:49
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xianggui7895

银虫 (小有名气)


★ ★
mingdong(金币+2):感谢交流! 2010-11-15 21:27:11
Wendydudu(金币+2):恩,谢谢你。 2010-11-16 20:09:53
DLPOLY: http://www.cse.scitech.ac.uk/ccg/software/DL_POLY/
看网站介绍吧 我也说不清有什么特点 和lammps都是通用的主流的经典md软件
3楼2010-11-15 15:23:10
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cdxy

至尊木虫 (著名写手)


★ ★
mingdong(金币+2):感谢交流! 2010-11-15 21:27:33
Wendydudu(金币+2):感谢交流! 2010-11-16 20:08:51
4楼2010-11-15 15:37:00
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