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Wendydudu

木虫 (小有名气)

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[交流] 【求助】请教分子动力学模拟软件选择

新手，从零开始学习分子动力学模拟。
打算做离子导体电导率的计算，也就是要算方均位移。除此之外，材料的应力性能，尤其是热应力性能是否能够计算出？
正在学习了解lammps，据称其计算能力强大，前后处理稍弱，如果用lammps大量的数据是如何处理的？
另外MS的discover有什么特点？
其他的分子动力学模拟软件有哪些？各有什么特点？
最后，是否能够通过分子动力学计算反应的活化能垒？
新人问题问题比较多，还望大家不吝赐教。感激不尽。

问题太多，能帮忙回答一条也是行。

[ Last edited by Wendydudu on 2010-11-10 at 15:33 ]

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分子动力学

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1楼 2010-11-10 11:15:33

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zhaoyanfei

木虫 (小有名气)

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★
dongdong3881(金币+1):多谢指导 2010-11-16 19:51:25
Wendydudu(金币+2):谢谢。能再详细点吗？ 2010-11-16 20:09:34

NAMD是一款功能强大的分子动力学软件，源代码开源，不过一般建议在Linux下用，你可以试试……

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5楼2010-11-16 10:38:02

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xianggui7895

银虫 (小有名气)

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★ ★
mingdong(金币+2):感谢交流！ 2010-11-13 13:29:43
Wendydudu(金币+5):谢谢你的帮助。不打算进入到量子力学领域，所以不打算通过密度泛函计算势函数，至少目前是这样的。能否再问下dlpoly大概是什么样的，有些什么特点？ 2010-11-15 09:15:03

我也做过一段是的md计算，用的是cpmd，可以从密度泛函计算作用势，如果你的体系没有合适的势函数，可以考虑这个。经典md的话，lammps和dlpoly是用的比较多的，discover功能肯定没有多强大，只是前后处理比较方便

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2楼2010-11-12 22:11:49

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