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【求助】请教分子动力学模拟软件选择
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Wendydudu
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【求助】请教分子动力学模拟软件选择
新手,从零开始学习分子动力学模拟。
打算做离子导体电导率的计算,也就是要算方均位移。除此之外,材料的应力性能,尤其是热应力性能是否能够计算出?
正在学习了解lammps,据称其计算能力强大,前后处理稍弱,如果用lammps大量的数据是如何处理的?
另外MS的discover有什么特点?
其他的分子动力学模拟软件有哪些?各有什么特点?
最后,是否能够通过分子动力学计算反应的活化能垒?
新人问题问题比较多,还望大家不吝赐教。感激不尽。
问题太多,能帮忙回答一条也是行。
[
Last edited by Wendydudu on 2010-11-10 at 15:33
]
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2010-11-10 11:15:33
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mingdong(金币+2):感谢交流! 2010-11-15 21:27:11
Wendydudu(金币+2):恩,谢谢你。 2010-11-16 20:09:53
DLPOLY:
http://www.cse.scitech.ac.uk/ccg/software/DL_POLY/
看网站介绍吧 我也说不清有什么特点 和lammps都是通用的主流的经典md软件
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2010-11-15 15:23:10
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xianggui7895
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mingdong(金币+2):感谢交流! 2010-11-13 13:29:43
Wendydudu(金币+5):谢谢你的帮助。不打算进入到量子力学领域,所以不打算通过密度泛函计算势函数,至少目前是这样的。能否再问下dlpoly大概是什么样的,有些什么特点? 2010-11-15 09:15:03
我也做过一段是的md计算,用的是cpmd,可以从密度泛函计算作用势,如果你的体系没有合适的势函数,可以考虑这个。经典md的话,lammps和dlpoly是用的比较多的,discover功能肯定没有多强大,只是前后处理比较方便
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2010-11-12 22:11:49
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mingdong(金币+2):感谢交流! 2010-11-15 21:27:33
Wendydudu(金币+2):感谢交流! 2010-11-16 20:08:51
http://lammps.sandia.gov/doc/Manual.html
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2010-11-15 15:37:00
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zhaoyanfei
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dongdong3881(金币+1):多谢指导 2010-11-16 19:51:25
Wendydudu(金币+2):谢谢。能再详细点吗? 2010-11-16 20:09:34
NAMD是一款功能强大的分子动力学软件,源代码开源,不过一般建议在Linux下用,你可以试试……
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2010-11-16 10:38:02
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