24小时热门版块排行榜    

查看: 2780  |  回复: 8
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

小心点

金虫 (正式写手)


[交流] 【求助/交流】寻找基因组序列中的单拷贝基因

最近要做实时定量PCR确定质粒拷贝数,但是需要基因组中的一个单拷贝基因作为标准品。这个种的几个菌的基因组已经有一些被报道并发布了,很好找。
但是请问怎么从这些基因组中找出能被国际承认的单拷贝标准基因呢?
希望做相关实验的前辈们和同学们能不吝赐教,谢谢~~
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

minfeng0608

新虫 (初入文坛)


★ ★
dhd997(金币+2):谢谢交流 2010-11-18 08:42:38
小心点(金币+2):如何选择blast的备选基因序列呢?一个基因组那么多基因,不能一个一个都blast的吧 2010-11-18 09:08:31
BLAST结果,通过其每个结果的描述可看出,如果显示该物种很多染色体上都有该片段,则剔除;只选择该物种某一条染色体的某个特定位置有该片段,别的位置都没有的,只有在别的物种才有的,是不是这样啊,仅供参考啊。。。
8楼2010-11-18 08:37:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

小心点

金虫 (正式写手)


人工置顶...有没有人帮个忙啊?貌似要做基因组方面工作的童鞋才行
2楼2010-11-15 17:50:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

minfeng0608

新虫 (初入文坛)



小心点(金币+1):谢谢参与
小心点(金币+2):理论上是这样的,但你怎么拿到你认为是单拷贝的基因序列的呢? 2010-11-18 09:06:35
我也需要用一些单拷贝基因来试验,我只是得到这些基因的序列,通过BLAST,如果结果中只有一个该物种目标片段,能否认为其是单拷贝啊。。。
4楼2010-11-17 20:35:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

minfeng0608

新虫 (初入文坛)


我也需要用一些单拷贝基因来试验,我只是得到这些基因的序列,通过BLAST,如果结果中只有一个该物种目标片段,能否认为其是单拷贝啊。。。
5楼2010-11-17 20:41:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[文学芳草园] 梦想 +5 myrtle 2026-08-26 8/400 2026-09-02 02:42 by Leogzhya
[基金申请] 面上函评意见出来了,像什么等级? 20+4 Tsingking1 2026-08-27 17/850 2026-09-01 19:51 by 超级无敌华子
[基金申请] 学科评审组评审是指会评吗? +4 瞬息宇宙 2026-08-31 4/200 2026-09-01 14:58 by jiaoxg
[论文投稿] 小白求助 投论文要求的highlights应该如何写 5+3 l1963982152 2026-08-29 4/200 2026-09-01 09:04 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 麻烦专家们看看评委们的意见(F口面上) +7 gdd2018 2026-08-28 12/600 2026-09-01 08:32 by 尼古拉斯小虫
[基金申请] 国社科又开始会评了,不知道这次命运如何 +7 雨打竹帘 2026-08-30 11/550 2026-08-31 23:16 by hittle2008
[基金申请] 哪位高人中了,把查询到的截图贴出来让我看看,让我长长见识 +6 yuleib84 2026-08-26 7/350 2026-08-31 19:46 by 鱼翔浅底1
[基金申请] 面上意见出来了 +12 黄鸟于飞Chao 2026-08-29 23/1150 2026-08-31 18:57 by 黄鸟于飞Chao
[基金申请] 29号明天会评吗 +4 笨笨唐 2026-08-28 4/200 2026-08-31 09:30 by huixian257
[基金申请] 基金不中,共勉 +12 eulota 2026-08-26 12/600 2026-08-31 08:42 by ZJTJZ
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +7 德尚中行 2026-08-27 8/400 2026-08-30 20:52 by purplejack
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +4 bud_bud 2026-08-27 7/350 2026-08-29 07:23 by foolishmani
[基金申请] 系统查不到 +11 董八千 2026-08-26 11/550 2026-08-28 18:06 by Leogzhya
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 9/450 2026-08-28 11:06 by maolC
[基金申请] 怎么查啊 +6 huang1991js 2026-08-26 6/300 2026-08-28 08:42 by winsaint
[基金申请] 我不理解! +15 Edward_pc 2026-08-26 23/1150 2026-08-26 20:34 by zzuzxg
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 国际合作可查了,中了面上 (EPI+1)(金币+50) +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
信息提示
请填处理意见