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njuxyh

木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】SIESTA计算总能等自洽计算时力准不准阿已有3人参与

siesta: Atomic forces (eV/Ang):
     1    0.002280    0.001885    0.000011
     2   -0.000823   -0.002001    0.000006
     3   -0.002785    0.000413   -0.000004
     4   -0.003841   -0.003846    0.000010
     5   -0.003414    0.002833   -0.000021
     6    0.002270    0.000616    0.000007
     7   -0.000137    0.002821    0.000011
     8    0.000639    0.000494   -0.000006
     9   -0.004456    0.004070    0.000019
上面是优化后的受力,已经达收敛标准了
我用这个结构,再做scf计算
发现siesta: Atomic forces (eV/Ang):
   1    0.002875   -0.084867    0.035258
   2   -0.000382    0.039908    0.042227
   3   -0.003277    0.002771    0.036465
   4   -0.001384   -0.004595    0.035799
   5   -0.001858    0.005840    0.035947
   6    0.006556   -0.000592    0.036087
   7    0.001250   -0.038206    0.042518
   8    0.000911    0.087377    0.035318
   9   -0.003271   -0.001110    0.034860
  10    0.002253   -0.013611    0.034873
  11   -0.001831    0.004953    0.035918
  12    0.001754   -0.005937    0.035983
可以看出,自洽计算时的输出的力和优化后输出的力不一样阿
现在的问题:是不是 SIESTA计算总能等自洽计算时力算不准呢
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zhangguangping

木虫 (著名写手)


zxzj05(金币+1):感谢交流! 2010-11-05 21:04:27
引用回帖:
Originally posted by njuxyh at 2010-11-05 08:13:37:
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
     1    0.002280    0.001885    0.000011
     2   -0.000823   -0.002001    0.000006
     3   -0.002785    0.000413   -0.000004
     4   -0.003841   -0.003846   ...

如果你新的计算SCF自洽结束的话,应该差别不是很大。
弘德明志博学笃行
2楼2010-11-05 17:18:21
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njuxyh

木虫 (著名写手)

这就是自洽最后的结果:
1    0.002875   -0.084867    0.035258
   2   -0.000382    0.039908    0.042227
   3   -0.003277    0.002771    0.036465
   4   -0.001384   -0.004595    0.035799
   5   -0.001858    0.005840    0.035947
   6    0.006556   -0.000592    0.036087
   7    0.001250   -0.038206    0.042518
   8    0.000911    0.087377    0.035318
   9   -0.003271   -0.001110    0.034860
  10    0.002253   -0.013611    0.034873
  11   -0.001831    0.004953    0.035918
  12    0.001754   -0.005937    0.035983

本文来自: 小木虫论坛 http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2565072&page=1#pid1801284

[ Last edited by njuxyh on 2010-11-5 at 17:56 ]
3楼2010-11-05 17:55:28
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zhangguangping

木虫 (著名写手)


zxzj05(金币+1):感谢交流! 2010-11-05 21:04:44
njuxyh(金币+5): 2010-11-08 10:12:43
引用回帖:
Originally posted by njuxyh at 2010-11-05 10:55:28:
这就是自洽最后的结果:
1    0.002875   -0.084867    0.035258
   2   -0.000382    0.039908    0.042227
   3   -0.003277    0.002771    0.036465
   4   -0.001384   -0.004595    0.035799
   5   - ...

好像这个就是传说中的不同的初始DM猜测得到不同的结果吧。我在siesta-3.0-b和siesta-3.0-rc2之间遇到过这个问题。
弘德明志博学笃行
4楼2010-11-05 19:46:34
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njuxyh

木虫 (著名写手)

你是说版本不同造成的?
5楼2010-11-05 20:19:37
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zhangguangping

木虫 (著名写手)


zxzj05(金币+1):感谢交流! 2010-11-05 21:05:04
引用回帖:
Originally posted by njuxyh at 2010-11-05 13:19:37:
你是说版本不同造成的?

我还没遇到同一个版本中你的情况,但是我遇到两个版本中是有这个问题的。但是他们同一个初始条件能得到一致的结果,但是让他们自己猜测,结果就不同了。
弘德明志博学笃行
6楼2010-11-05 20:31:52
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njuxyh

木虫 (著名写手)

谢谢,不知道这些差别会不会影响我得总能计算?因为感觉后者的原子受力比较大,好想不是最稳定的结构?
7楼2010-11-06 10:06:43
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zhangguangping

木虫 (著名写手)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
cenwanglai(金币+2):谢谢回复! 2010-11-08 12:48:01
引用回帖:
Originally posted by njuxyh at 2010-11-06 03:06:43:
谢谢,不知道这些差别会不会影响我得总能计算?因为感觉后者的原子受力比较大,好想不是最稳定的结构?

即使是同一个版本,在用siesta的时候如果收敛了,再次运算的话,如果用上一个DM,会在1到2个SCF之内自洽。但是如果是做输运用transiesta的话,即使是收敛过的DM,如果再次用,还会发现不收敛,并且经过的SCF比较多。这个确实是一个问题。但是你的问题我在使用siesta的时候没有遇到过。尤其是你的几何结构是按照绝对的收敛条件来的。按照这个结构再去算一次,即使是从头猜测DM,只要收敛了,当然DM的收敛标准一定要和优化的时候用的一样的收敛标准。那么应该收敛后的受力应该不会差别很大,最起码还是满足几何结构优化的时候的那个条件的。你的这个问题可以写信给siesta-l@uam.es,这个是siesta的一个讨论区,但是需要注册才能给这个地址发邮件。有可能你的问题,在这个能找到答案。
弘德明志博学笃行
8楼2010-11-08 10:23:43
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njuxyh

木虫 (著名写手)

谢谢,学习了
9楼2010-11-09 10:20:16
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295399157

新虫 (初入文坛)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
我用atk来算一个碳管的透射谱,算了几天后出现一个这样的错误命令提示“Exceed  maximum self-consistent ”。请问哪位高人知道这该怎么办?
10楼2010-11-27 22:38:25
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