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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】审稿意见求助
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sunxiuxin

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】审稿意见求助

高斯计算超极化率，得到的beta-yyy为负值，在结果文件最后一段Miu-y(原子单位处)也为负值，审稿人说“Miu_y为负值，很明显，这个分子的Beta_yyy应该是正值”同时意见中指出“决定beta正负值的是电子跃迁方向与基态偶极矩的方向的关系，而不是分子取向”，所以审稿人认为读取的Gaussian程序的输出结果是错误的。关于高斯程序计算极化率的符号问题查到这样一篇文献《Gaussian程序计算的一阶超极化率的符号问题》，该文献指出高斯用polar和polar(enonly)关键词计算的beta的各分量符号应变号，请教大家应该变号吗，计算得到的偶极矩与超极化率的符号存在相反的关系吗？
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1楼 2010-11-04 19:05:38
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ykwang

金虫 (正式写手)
sunxiuxin(金币+1): 2010-11-04 20:50:27
不同的量子化学程序包计算的超极化率分量符号并不完全相同（可能差一负号），原因在于它们所用的公式或定义不同。你应该查一下程序引用的原始文献，以确定哪一种定义符合现有的规范。
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Nothing_Is_Impossible!
2楼2010-11-04 20:17:50
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sunxiuxin

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by ykwang at 2010-11-04 20:17:50:
不同的量子化学程序包计算的超极化率分量符号并不完全相同（可能差一负号），原因在于它们所用的公式或定义不同。你应该查一下程序引用的原始文献，以确定哪一种定义符合现有的规范。

谢谢，我去查一下文献。可是还有疑问，我采用同样的方法和基组在高斯程序里算了一个有实验值的，计算得到的分量值和实验值符号是吻合的。
还有在我的体系中存在这样一个问题，结果文件两处的偶极矩符号不一致，注：体系带有正电荷
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3楼2010-11-04 20:53:57
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ykwang

金虫 (正式写手)
sunxiuxin(金币+1): 2010-11-04 21:12:26
引用回帖:
Originally posted by sunxiuxin at 2010-11-04 20:53:57:

谢谢，我去查一下文献。可是还有疑问，我采用同样的方法和基组在高斯程序里算了一个有实验值的，计算得到的分量值和实验值符号是吻合的。
还有在我的体系中存在这样一个问题，结果文件两处的偶极矩符号不一致， ...

带电荷的体系，电偶极矩是原点依赖性的（因而不是“好”的物理量）。你查一下是否是因为原点的选取不同造成的。
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Nothing_Is_Impossible!
4楼2010-11-04 21:08:27
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sunxiuxin

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by ykwang at 2010-11-04 21:08:27:

带电荷的体系，电偶极矩是原点依赖性的（因而不是“好”的物理量）。你查一下是否是因为原点的选取不同造成的。

这个问题我们注意到了，在计算文件中输入了nosymm关键词，坐标应该不变
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5楼2010-11-04 21:12:17
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ykwang

金虫 (正式写手)
sunxiuxin(金币+1): 2010-11-04 21:46:33
引用回帖:
Originally posted by sunxiuxin at 2010-11-04 21:12:17:

这个问题我们注意到了，在计算文件中输入了nosymm关键词，坐标应该不变

不论有无nosymm关键词，坐标总要被转换到标准取向。如果的确没有对称性，那么标准取向不是唯一的。
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Nothing_Is_Impossible!
6楼2010-11-04 21:17:51
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sunxiuxin

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by ykwang at 2010-11-04 21:17:51:

不论有无nosymm关键词，坐标总要被转换到标准取向。如果的确没有对称性，那么标准取向不是唯一的。

怎么查看标准取向呢？
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7楼2010-11-04 21:24:09
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ykwang

金虫 (正式写手)
sunxiuxin(金币+1): 2010-11-04 21:46:37
引用回帖:
Originally posted by sunxiuxin at 2010-11-04 21:24:09:

怎么查看标准取向呢？

在Gaussian输出文件中查找Standard orientation即可。
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Nothing_Is_Impossible!
8楼2010-11-04 21:29:09
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lihb734

铁杆木虫 (职业作家)

站在计算化学入门的门槛上
sunxiuxin(金币+1): 2010-11-04 21:46:44
楼主可以参见二能级公式，来判断审稿人的意见是否正确，我看了一眼你给的文献，审稿人的似乎是有道理的。
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前途光明，出路难觅！
9楼2010-11-04 21:36:41
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sunxiuxin

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by lihb734 at 2010-11-04 21:36:41:
楼主可以参见二能级公式，来判断审稿人的意见是否正确，我看了一眼你给的文献，审稿人的似乎是有道理的。

那我只能算激发态了吧
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10楼2010-11-04 21:42:50
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