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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 【求助】如何根据cell文件写poscar
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xiaowu787

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】如何根据cell文件写poscar 已有3人参与

刚开始学ASP,看论坛上高手说过可以通过MS写OSCAR。从MS 导出cell文件,还是不知道该如何写出基矢？请高手指点一下。原子的个数就是BLOCK POSITIONS_FRAC中的原子个数吗？谢谢！！

Al2O3
PBC    4.7590    4.7590   12.9910   90.0000   90.0000  120.0000 (P1)

cell文件如下：

%BLOCK LATTICE_CART
       2.747609931073429       0.000000000000000       4.330333333333333
      -1.373804965536714       2.379500000000001       4.330333333333333
      -1.373804965536714      -2.379500000000000       4.330333333333333
%ENDBLOCK LATTICE_CART

%BLOCK POSITIONS_FRAC
  O   0.5559999999999998  -0.0559999999999999   0.2500000000000000
  O   0.2500000000000000   0.5559999999999998  -0.0559999999999999
  O  -0.0559999999999999   0.2500000000000000   0.5559999999999998
  O  -0.5559999999999998   0.0559999999999999  -0.2500000000000000
  O  -0.2500000000000000  -0.5559999999999998   0.0559999999999999
  O   0.0559999999999999  -0.2500000000000000  -0.5559999999999998
Al   0.3519999999999999   0.3519999999999999   0.3519999999999999
Al   0.1480000000000001   0.1480000000000001   0.1480000000000001
Al  -0.3519999999999999  -0.3519999999999999  -0.3519999999999999
Al   0.8520000000000000   0.8520000000000000   0.8520000000000000
%ENDBLOCK POSITIONS_FRAC
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1楼 2010-11-02 22:53:55
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cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

老和山猥琐派九段

优秀版主
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by xiaowu787 at 2010-11-03 16:14:15:



这个脚本没有声明shell,脚本运行不必拷到/usr/bin/目录下，一般只需要更改一下运行权限就可以了。正准备测试一下,谢谢

呵呵，刚学习linux的时候编写的一个脚本，很久没有检查了。幸苦！你测试后帮修改再发一个吧。
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9楼2010-11-03 16:17:16
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xiaowu787

木虫 (正式写手)
这是从其他地方查到的信息,请高手指点一下，是不是问题太简单了？可是我没做过这方面的。

•Prototype: αAl2O3
•Pearson Symbol: hR10
•Strukturbericht Designation: D51
•Space Group: R3c (Cartesian and lattice coordinate listings available)
•Number: 167
•Reference: Villars and Calvert, Pearson's Handbook, Vol. I, pp. 970-1
•Primitive Vectors:
A1  =  b X + a Y + a Z
A2  =  a X + b Y + a Z
A3  =  a X + a Y + b Z
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2楼2010-11-03 11:07:33
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bingmou

金虫 (著名写手)
★ ★
xiaowu787(金币+5):谢谢答复！ 2010-11-03 11:35:12
cenwanglai(金币+2):谢谢回复！ 2010-11-03 13:22:21
示例：
Al2O3
1.0
      2.747609931073429       0.000000000000000       4.330333333333333
      -1.373804965536714       2.379500000000001       4.330333333333333
      -1.373804965536714      -2.379500000000000       4.330333333333333
6 4 !前面为O的个数，后面为Al的个数，这个顺序要和POTCAR对应
Direct !MS的都是Direct
   0.5559999999999998  -0.0559999999999999   0.2500000000000000
   0.2500000000000000   0.5559999999999998  -0.0559999999999999
  -0.0559999999999999   0.2500000000000000   0.5559999999999998
  -0.5559999999999998   0.0559999999999999  -0.2500000000000000
  -0.2500000000000000  -0.5559999999999998   0.0559999999999999
   0.0559999999999999  -0.2500000000000000  -0.5559999999999998
   0.3519999999999999   0.3519999999999999   0.3519999999999999
   0.1480000000000001   0.1480000000000001   0.1480000000000001
  -0.3519999999999999  -0.3519999999999999  -0.3519999999999999
   0.8520000000000000   0.8520000000000000   0.8520000000000000
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3楼2010-11-03 11:17:57
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xiaowu787

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by bingmou at 2010-11-03 11:17:57:
示例：
Al2O3
1.0
      2.747609931073429       0.000000000000000       4.330333333333333
      -1.373804965536714       2.379500000000001       4.330333333333333
      -1.373804965536714       ...

由于基失包含了晶格常数，只需把晶格缩放系数设为1是吧。再问一下，晶格缩放系数设为1和通过转换变成较大的数有区别吗？谢谢！
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4楼2010-11-03 11:34:49
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