| 查看: 5306 | 回复: 32 | |||||||||||
| 本帖产生 1 个 模拟EPI ，点击这里进行查看 | |||||||||||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||||||||||
shengxiang木虫 (著名写手)
|
[交流]
【讨论】系综问题
|
||||||||||
|
系综的定义大家或多或少的都有所了解，但是在进行动力学模拟时怎么选择系综呢？看很多文献中都是先跑NPT，然后再跑NVT（或者NVE），这样跑的目的应该是先用NPT跑出一个合适的密度（也就是盒子尺寸）。但是，可不可以用NPT系综一下跑到底呢？这对于数据的分析有什么影响？欢迎大家一起来讨论，金币可追加！ [ Last edited by ghcacj on 2010-11-1 at 10:47 ] |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 晶体模型计算分析 | 分子动力学 | MD分子动力学 | 动力学或热力学计算 |
| 长远发展 | 杂七杂八 | 分子模拟 | MDSimulation |
» 猜你喜欢
真诚求助：手里的省社科项目结项要求主持人一篇中文核心，有什么渠道能发核心吗
已经有8人回复
-
寻求一种能扛住强氧化性腐蚀性的容器密封件
已经有5人回复
-
论文投稿，期刊推荐
已经有6人回复
-
请问哪里可以有青B申请的本子可以借鉴一下。
已经有4人回复
-
孩子确诊有中度注意力缺陷
已经有14人回复
-
请问下大家为什么这个铃木偶联几乎不反应呢
已经有5人回复
-
请问有评职称，把科研教学业绩算分排序的高校吗
已经有5人回复
-
2025冷门绝学什么时候出结果
已经有3人回复
-
天津工业大学郑柳春团队欢迎化学化工、高分子化学或有机合成方向的博士生和硕士生加入
已经有4人回复
-
康复大学泰山学者周祺惠团队招收博士研究生
已经有6人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
MS模拟 周期性条件 没有看到分子进入模拟盒
已经有5人回复- NPT系综下判断是否平衡的标志
已经有12人回复
- 正则系综和微正则系综
已经有9人回复
- NPT系综动力学
已经有19人回复
- gromacs 模拟NPT系宗出问题
已经有8人回复
- NVT系综动力学模拟气相无法平衡
已经有7人回复
- 分子动力学模拟中的系综问题
已经有5人回复
- gromacs NPT 系综如何模拟？
已经有8人回复
- OpenGL超级宝典第5版中例子的问题
已经有8人回复
- 做MD计算时系综NVT中体积不变 但是这个体积怎么规定的 有具体大小吗？
已经有4人回复
- 紧急请教：VASP模拟STM遇到的问题
已经有5人回复
- 求助用MS模拟气体在分子筛中扩散系数时碰到的问题
已经有20人回复
- 巨正则系综蒙特卡洛方法是怎样计算吸附过程的
已经有14人回复
- 第一原理动力学的系综选择，和各种系综的输入文件Example
已经有13人回复
- 请问海水淡化过程海水的物性模拟是从哪方面开始的
已经有4人回复
- Gibbs系综和NPT系综的区别
已经有4人回复
- nvt系综，系统总能量震荡厉害
已经有9人回复
- 【求助】VASP做分子动力学模拟NVT系综下为啥内能竟然是升高的？
已经有8人回复
- NPT系综的平衡问题
已经有10人回复
- 【求助】NVT弛豫问题
已经有3人回复
- 【求助】计算固体热膨胀系数
已经有8人回复
- 【讨论】lammps中怎样检验模拟系统在NVT系综下弛豫是否达到平衡？
已经有6人回复
- 【求助】请问NVE系宗的问题
已经有8人回复
bay__gulf
金虫 (著名写手)
刘苏州
- 模拟EPI: 8
- 应助: 9 (幼儿园)
- 贵宾: 4.85
- 金币: 2332.8
- 红花: 1
- 帖子: 1344
- 在线: 271小时
- 虫号: 592012
- 注册: 2008-09-03
- 专业: 理论和计算化学
- 管辖: 分子模拟
7楼2010-10-31 11:11:46
tianlangxingaa
铁杆木虫 (著名写手)
- 模拟EPI: 1
- 应助: 52 (初中生)
- 贵宾: 0.02
- 金币: 7464.2
- 红花: 19
- 帖子: 1283
- 在线: 735.1小时
- 虫号: 438857
- 注册: 2007-09-30
- 专业: 理论和计算化学
2楼2010-10-31 08:53:10
dellus
木虫 (职业作家)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 贵宾: 0.08
- 金币: 5305.6
- 散金: 35
- 红花: 1
- 沙发: 2
- 帖子: 3469
- 在线: 285.9小时
- 虫号: 92581
- 注册: 2005-09-10
- 性别: GG
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
shengxiang(金币+1):谢谢参与
zh1987hs(金币+6):谢谢 2010-10-31 11:29:51
shengxiang(金币+10): 2010-11-01 23:31:51
shengxiang(金币+1):谢谢参与
zh1987hs(金币+6):谢谢 2010-10-31 11:29:51
shengxiang(金币+10): 2010-11-01 23:31:51
|
当然可以采用一种系综进行模拟 各种系综之间原则上是等价的，例如，在一个简单体系，采用NVT计算出P0，再把这个P0放入NPT进行计算V，NVT中采用的V0应该在NPT得到V的error bar之内。这个是一个重要的检查程序对错的方法。 在模拟中选取哪一种系综要看你要研究的问题是什么 譬如说，如果研究的是分相问题，最好采用NPT，因为体系在NVT中会形成相界面，会造成两相的计算很不准； 相反，如果研究相界面之间的tenssion，NVT反而更合适； 再者，研究吸附问题，muVT是比较合适的系综。 像你说的先用NPT再用NVT很可能是这种情况，在做硬球模型时，直接把球放到比较小的盒子里很不方便（因为球和球不能接触），所以先把球放入一个很大的盒子，然后在大的压强下产生一个适合小盒子的initial configuration。 另外，产生一个适合密度的说法不太准确，因为你不一定知道NPT采用的压强是否适合。 [ Last edited by dellus on 2010-10-31 at 09:28 ] |
4楼2010-10-31 09:27:27
5楼2010-10-31 09:28:52