24小时热门版块排行榜    

查看: 2213  |  回复: 11
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

xiafuting

新虫 (小有名气)

[交流] 【讨论】【求助】固定键长优化,成功收敛;不固定键长放开全优化不收敛?

一条反应途径的各个稳定点在气相中优化都成功收敛。但审稿人要求在溶液中优化。
其中的一个过渡态在溶液中优化时总是往该过渡态链接的前一个中间体或后一个中间体跑。
于是我将这个过渡态的关键键长固定(使它不跑向任何一个中间体)后优化,成功收敛,虚频震动模式也对。
可是把固定的键长放开再全优化,又跑向中间体了。而且离收敛标准也远。请问在放开后优化有什么技巧吗?
我的输入是
%nproc=4
%mem=3400mb
# ub3lyp/6-31++g(df,p) opt(ts,calcfc,maxcycle=300,notrustupdate,noeigen) scf(maxcycle=400) iop(1/8=1) freq=noraman scrf=(solvent=water,pcm,read) test nosymm
在气相中优化时此过渡态很容易收敛的,为何加了PCM后,改变这么大呢?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

manson1998

金虫 (著名写手)

OLED达人

引用回帖:
Originally posted by xiafuting at 2010-10-29 14:36:15:

呵呵,太凑巧了。
我投出去的文章就是在气相中做了优化,然后溶液中做的单点,但审稿人说不够,要在溶液中优化。而且两个审稿人都这样说,别无选择啊。呵呵!
另外,我的初始模型中就引入了6个水溶剂分子的。 ...

我觉得你引入了6个水溶剂分子了,审稿人还需要你做溶剂化?太苛刻了吧。你用的基组是什么
惺惺相惜情不自禁
8楼2010-10-29 15:22:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 12 个回答

manson1998

金虫 (著名写手)

OLED达人


xiafuting(金币+2): 2010-10-29 14:19:35
zhou2009(金币+1): 2010-10-29 15:11:15
有溶剂作用啊 说明溶剂化下的ts结构与气相的ts结构有差异的
惺惺相惜情不自禁
2楼2010-10-29 13:08:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiafuting

新虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by manson1998 at 2010-10-29 13:08:07:
有溶剂作用啊 说明溶剂化下的ts结构与气相的ts结构有差异的

恩。我也这样觉得。可气相中成功优化出来的过渡态怎么看怎么顺眼,一放到PCM下优化就跑向中间体了。现在要在溶液中重新找过渡态,好难重新设计初始结构哦。
3楼2010-10-29 14:19:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ykwang

金虫 (正式写手)

★ ★ ★
xiafuting(金币+1):谢谢参与
xiafuting(金币+1): 2010-10-29 14:37:22
zhou2009(金币+2): 2010-10-29 15:12:20
xiafuting(金币+2): 2010-10-29 15:35:21
如果你用的是Gaussian03就别费劲了,能收敛是你的运气,不收敛才是常态。因为其溶液优化算法存在明显的缺陷(尽管Gaussian程序员不愿承认)。Gaussian09没有仔细研究过,但据说有了明显改进,特别是在溶剂参数方面的改进比较大,可以去试一试。
Nothing_Is_Impossible!
4楼2010-10-29 14:21:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的? +15 爱看书的可乐 2026-08-26 17/850 2026-08-27 16:41 by xxniao123
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 (金币+5) +10 晴天加油 2026-08-26 11/550 2026-08-27 16:35 by msuhlx
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高,自己申请怎么就这么难 +7 Kittylucky 2026-08-27 7/350 2026-08-27 16:31 by msuhlx
[基金申请] 基金未中,这种答复是模板吗? +5 zhaosm1982 2026-08-27 6/300 2026-08-27 16:00 by lfy8008
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +5 叶九微 2026-08-26 5/250 2026-08-27 10:35 by l_zh2008
[基金申请] 为什么 国际(地区)合作与交流项目 没有放榜? 10+3 majunge000 2026-08-26 11/550 2026-08-27 08:42 by 北京莱茵编辑
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 LIbGuocjEEYw 2026-08-26 4/200 2026-08-27 02:01 by Ie9AyIAvGbvs
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +7 process2012 2026-08-23 10/500 2026-08-26 19:23 by hmhminy
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +23 koalala 2026-08-24 26/1300 2026-08-26 14:29 by 宝贝虫子
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 哪位高人中了,把查询到的截图贴出来让我看看,让我长长见识 +4 yuleib84 2026-08-26 5/250 2026-08-26 13:40 by yuleib84
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 今天务委会开完了,明天出结果吗 +19 angus9576 2026-08-25 23/1150 2026-08-26 10:03 by zp519
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候,我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
[基金申请] 某些机构,以效率低为荣,以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑,不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
[基金申请] 我面上完蛋了 +13 且听虎啸 2026-08-20 14/700 2026-08-25 09:10 by mrkang
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +13 kulium 2026-08-21 16/800 2026-08-24 16:27 by superceng
[基金申请] 看来今天不会放榜了? +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
信息提示
请填处理意见