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suny2005

木虫 (小有名气)

[交流] 【求助】关于离子液体体系平衡检测 已有3人参与

不知道论坛里有没有做离子液体体系的虫友啊?我想问一下,大家在检查体系是否平衡的时候一般用什么参数,如能量、温度、体积、密度,还是和生物体系一样用rmsd啊?这种材料体系用rmsd值检测平衡对不对啊?

[ Last edited by ghcacj on 2010-10-28 at 13:58 ]
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suny2005

木虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by david.wang at 2010-10-27 23:06:24:
一般来检测密度,只要与实验值符合上就可以了。

这是检测力场可靠不可靠,而不是检测体系平衡。
6楼2010-10-28 08:40:42
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zyj8119

木虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by suny2005 at 2010-10-27 21:37:07:
不知道论坛里有没有做离子液体体系的虫友啊?我想问一下,大家在检查体系是否平衡的时候一般用什么参数,如能量、温度、体积、密度,还是和生物体系一样用rmsd啊?这种材料体系用rmsd值检测平衡对不对啊?

你用什么软件做的?
好好学习,天天向上。
2楼2010-10-27 21:40:40
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david.wang

新虫 (小有名气)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
zh1987hs(金币+1):谢谢 2010-10-28 08:08:46
一般来检测密度,只要与实验值符合上就可以了。
4楼2010-10-27 23:06:24
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zyj8119

木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by suny2005 at 2010-10-27 21:42:07:
gromacs

我想问下使用GROMACS做离子液体,那么力场的itp文件怎么搞,然后假如使用GAUSSVIEW画出离子液体的结构,在使用PDB2GMX的时候,只能选用GMX中已有的力场,怎么才能用自己写的力场去进行这一步转化呢?
好好学习,天天向上。
5楼2010-10-27 23:37:35
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