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【求助/交流】请问启动子的分析软件那个好用
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li_wyman
金虫
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专业: 作物种质资源与遗传育种学
[交流]
【求助/交流】请问启动子的分析软件那个好用
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请问启动子的分析软件那个好用
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1楼
2010-10-27 19:43:46
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0616102018
木虫
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小木虫(金币
+0.5
):给个红包,谢谢回帖
www.ifti.org
TFsite
核心启动子及转录起始位点预测使用在线工具NNPP(
http://www.fruitfly.org/seq_tools/promoter.html)
调控元件结合位点分析站
http://www.gene-regulation.com
http://www-bimas.cit.nih.gov/molbio/signal/
http://www.gene-regulation.com
网站中提供的AliBaba 2.1、Match程序
http://www.cbil.upenn.edu/cgi-bin/tess/tess
http://www.cbrc.jp/research/db/TFSEARCH.ht
我在文献上面看到用这几个网站的比较多,希望对你有帮助。我也在分析启动子上游调控序列,但是网站上面预测的结合位点太多并且不同网站预测结果不一样。这需要自己慢慢筛选。总之,工作量很大并且很麻烦。
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有勇气就会有奇迹!
8楼
2011-08-24 17:46:39
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ben1147
木虫
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专业: 微生物生理与生物化学
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dhd997(金币+1):谢谢交流。 2010-10-28 08:36:16
一般都是用数据库吧
PlantCARE,PLACE之类的
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2楼
2010-10-27 21:31:31
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woshiap
铁虫
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性别: GG
专业: 发育生物学
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小木虫(金币
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):给个红包,谢谢回帖交流
这个很多!看看这个!
http://blog.sina.com.cn/s/blog_4bcbe35f0100m7g3.html
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4楼
2010-11-01 21:16:21
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豆豆鱼
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注册: 2010-07-04
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专业: 植物遗传学
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小木虫(金币
+0.5
):给个红包,谢谢回帖
植物的就用二楼所说的那两个分析就可以了
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6楼
2011-08-22 16:47:22
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