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li_wyman

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】请问启动子的分析软件那个好用 已有8人参与

请问启动子的分析软件那个好用
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1楼 2010-10-27 19:43:46
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0616102018

木虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
www.ifti.org                  TFsite
核心启动子及转录起始位点预测使用在线工具NNPP( http://www.fruitfly.org/seq_tools/promoter.html)
调控元件结合位点分析站http://www.gene-regulation.com
http://www-bimas.cit.nih.gov/molbio/signal/
http://www.gene-regulation.com网站中提供的AliBaba 2.1、Match程序
http://www.cbil.upenn.edu/cgi-bin/tess/tess
http://www.cbrc.jp/research/db/TFSEARCH.ht

我在文献上面看到用这几个网站的比较多，希望对你有帮助。我也在分析启动子上游调控序列，但是网站上面预测的结合位点太多并且不同网站预测结果不一样。这需要自己慢慢筛选。总之，工作量很大并且很麻烦。
赞一下(4人) 回复此楼
有勇气就会有奇迹！
8楼2011-08-24 17:46:39
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ben1147

木虫 (正式写手)
★
dhd997(金币+1):谢谢交流。 2010-10-28 08:36:16
一般都是用数据库吧
PlantCARE，PLACE之类的
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2楼2010-10-27 21:31:31
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woshiap

铁虫 (初入文坛)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
这个很多！看看这个！http://blog.sina.com.cn/s/blog_4bcbe35f0100m7g3.html
赞一下(2人) 回复此楼
4楼2010-11-01 21:16:21
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豆豆鱼

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
植物的就用二楼所说的那两个分析就可以了
赞一下(1人) 回复此楼
6楼2011-08-22 16:47:22
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