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454106649

木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】关于空间群方面的疑问

最近解析一个数据,遇到两个问题:
一个就是加精修时候出现的exti提示,在INS里加exti  0.01后R1值从0.10降到0.056,这个是不是有问题?
还有就是解到最后,有三个原子定不下来,暂定为碳(R1值已经到0.028了),这个晶胞参数应该是六方晶系,但是选空间群是只能选成三方,用PLATON转不了。最后那三个原子定不下来,是不是与空间群定的有关 ?三方和六方一样吗?为什么六方的晶胞参数却选不上对应的空间群?
这个是晶胞参数
CELL  0.71073   16.5189   16.5189   25.1275    90.000    90.000   120.000
我解结构用的空间群是R-3m,降到无心结构解的。
解得最终结果是

这个是GROW之后的

晶体不算是目标产物,主要想借助这个数据学些知识!
(小弟研一,这方面不太懂,很想弄明白,企盼各路英雄指点)
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454106649@qq.com
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454106649

木虫 (著名写手)

!!

帝夫:感谢您的回复! 2010-10-28 22:16:37
以前加exti后R1总没什么变化的,但是这个就变很多
454106649@qq.com
2楼2010-10-27 17:06:45
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454106649

木虫 (著名写手)

~~

帝夫:感谢您的回复! 2010-10-28 22:16:43
边上的三个C原子定不了,暂定的C。水作溶剂,配体还算稳定。
454106649@qq.com
3楼2010-10-27 17:08:35
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454106649

木虫 (著名写手)

!!!

帝夫:感谢您的回复! 2010-10-28 22:16:47
大家看看帖吧,怎么沉了,有观点发言,先谢了!
454106649@qq.com
4楼2010-10-28 13:28:02
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wujinji

金虫 (正式写手)

★
454106649(金币+5):谢谢 2010-10-28 14:39:02
帝夫(金币+1): 2010-10-28 22:16:54
R-3系列的三方和六方是可以互换的。晶胞参数也是可以变的,找体积最小的就没错了。在解析结构前手动改成六方或者三方的看看。
5楼2010-10-28 13:47:43
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454106649

木虫 (著名写手)

帝夫:感谢您的回复! 2010-10-28 22:16:57
引用回帖:
Originally posted by wujinji at 2010-10-28 13:47:43:
R-3系列的三方和六方是可以互换的。晶胞参数也是可以变的,找体积最小的就没错了。在解析结构前手动改成六方或者三方的看看。

没有可选的六方空间群!该怎么办呢?
454106649@qq.com
6楼2010-10-28 14:38:43
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wujinji

金虫 (正式写手)

454106649(金币+10): 2010-10-29 09:56:10
我想起来了,有很多发表的文章中都是用R-3的空间群,六方的晶胞参数,但是晶系选的是三方。能过cifcheck就行了。
7楼2010-10-29 09:35:12
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454106649

木虫 (著名写手)

1

引用回帖:
Originally posted by wujinji at 2010-10-29 09:35:12:
我想起来了,有很多发表的文章中都是用R-3的空间群,六方的晶胞参数,但是晶系选的是三方。能过cifcheck就行了。

主要是有三个原子定不了,难着了!
O(∩_∩)O谢谢你!
454106649@qq.com
8楼2010-10-29 09:56:01
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