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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 【求助】关于vasp进行分子动力学模拟的求助
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valenhou001

至尊木虫 (职业作家)
★
aylayl08(金币+1):谢谢专家 2010-10-27 20:26:03
ice_rain(金币+5):谢谢。 2010-10-27 22:19:34
引用回帖:
Originally posted by ice_rain at 2010-10-22 10:46:32:
我对分子动力学一点也不了解，就想模拟一下氧化表面小分子的动力学行为。（不知道表述清楚不）遇到问题如下
1.POSCAR 中加上Selective dynamics， 除了标记是做动力学模拟之外，是否有固定原子的作用。
2.由于是 ...

当然是可以固定离吸附层较远的原子层，只结构优化靠近吸附层近的原子层，以及分 子。（这里提的是结构优化)

具体要模拟多少步，那要看所模拟的体系是否达到了平衡态，在模拟的过程要自己检查的。
你可参考一下CPMD3.13.x的手册上，里面有列出cpmd和bomd通常所模拟的时间和时间步长。
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11楼2010-10-27 13:15:09
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hedaors

禁虫 (正式写手)

隐清堂主
★
aylayl08(金币+1):谢谢解释 2010-10-27 20:27:03
ice_rain(金币+2):谢谢 2010-10-27 22:19:47
引用回帖:
Originally posted by ice_rain at 2010-10-22 10:46:32:
1.POSCAR 中加上Selective dynamics， 除了标记是做动力学模拟之外，是否有固定原子的作用。

这就是固定原子的作用，不是标记做动力学模拟
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12楼2010-10-27 15:55:05
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jxx0108

木虫 (小有名气)
★
gzqdyouxia(金币+1):谢谢交流 2010-12-30 15:45:19
ice_rain(金币+3): 2011-04-25 21:20:20
我也想做动力学的方面，请问版主，我要在NVT系综下，在一个模拟盒子里面放三十六个水分子，请问版主这样的话，POSCAR 文件怎么写啊
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13楼2010-12-30 15:17:54
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