24小时热门版块排行榜    

查看: 3132  |  回复: 12

valenhou001

至尊木虫 (职业作家)


aylayl08(金币+1):谢谢专家 2010-10-27 20:26:03
ice_rain(金币+5):谢谢。 2010-10-27 22:19:34
引用回帖:
Originally posted by ice_rain at 2010-10-22 10:46:32:
我对分子动力学一点也不了解,就想模拟一下氧化表面小分子的动力学行为。(不知道表述清楚不)遇到问题如下
1.POSCAR 中加上Selective dynamics, 除了标记是做动力学模拟之外,是否有固定原子的作用。
2.由于是 ...

当然是可以固定离吸附层较远的原子层,只结构优化靠近吸附层近的原子层,以及分 子。(这里提的是结构优化)

具体要模拟多少步,那要看所模拟的体系是否达到了平衡态,在模拟的过程要自己检查的。
你可参考一下CPMD3.13.x的手册上,里面有列出cpmd和bomd通常所模拟的时间和时间步长。
11楼2010-10-27 13:15:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hedaors

禁虫 (正式写手)

隐清堂主


aylayl08(金币+1):谢谢解释 2010-10-27 20:27:03
ice_rain(金币+2):谢谢 2010-10-27 22:19:47
引用回帖:
Originally posted by ice_rain at 2010-10-22 10:46:32:
1.POSCAR 中加上Selective dynamics, 除了标记是做动力学模拟之外,是否有固定原子的作用。

这就是固定原子的作用,不是标记做动力学模拟
12楼2010-10-27 15:55:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jxx0108

木虫 (小有名气)


gzqdyouxia(金币+1):谢谢交流 2010-12-30 15:45:19
ice_rain(金币+3): 2011-04-25 21:20:20
我也想做动力学的方面,请问版主,我要在NVT系综下,在一个模拟盒子里面放三十六个水分子,请问版主这样的话,POSCAR 文件怎么写啊
13楼2010-12-30 15:17:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 ice_rain 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
信息提示
请填处理意见