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wzh上善若水

木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】vasp优化晶格参数a 已有8人参与

vasp优化晶格参数a,侯柱峰教程中:
准备好一个poscar文件,得到Volume-Etotal的数据,运行脚本程序
#!/bin/sh
rm WAVECAR
for i in 3.80 3.85 3.90 3.95 4.00 4.05 4.10 4.15 4.20 4.25 4.30
do
cat > POSCAR < Al-fcc
$i
0.0 0.5 0.5
0.5 0.0 0.5
0.5 0.5 0.0
1
Direct
0.0 0.0 0.0
!
echo / a = $i angstrom /; time vasp
E=‘grep /TOTEN0 OUTCAR | tail -1 | awk -{printf /%12.6f \n0, $5 }.‘
V=‘grep /volume0 OUTCAR | tail -1 | awk -{printf /%12.4f \n0 , $5}.‘
echo $V $E >>EtVo.dat
done
小弟菜鸟,请问如何运行脚本
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xiaowu787

木虫 (正式写手)

★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by bingmou at 2010-10-25 15:15:40:
你要注意V=`后面的引号是反引号`,也就是键盘上1左边的纳和键,而不是单引号’。
同样最后的‘也是反引号`

time是用来看这个计算要花多少时间,属于让自己多点耐心的设置

谢谢您的解答:
试着做这个例子时,发现LDA和GGA的差别很大,下图是一篇文献上用VASP-GGA-PW91算的fcc(最下面的那根红线)的结果,经过单位23.06换算后,我用GGA-PW91算的结果在85Kcal/mol,差别怎么这么大?请版主帮忙分析一下原因。谢谢!

LDA-的计算结果
3.80 13.720000 -4.071701
3.85 14.270000 -4.117942
3.90 14.830000 -4.147312
3.95 15.410000 -4.162867
4.00 16.000000 -4.165279
4.05 16.610000 -4.156421
4.10 17.230000 -4.137987
4.15 17.870000 -4.111258
4.20 18.520000 -4.077605
4.25 19.190000 -4.038274
4.30 19.880000 -3.993437

GGA-的计算结果
a= 3.80    -3.533891      13.720000
a= 3.85    -3.598180      14.270000
a= 3.90    -3.644692      14.830000
a= 3.95    -3.675400      15.410000
a= 4.00    -3.692204      16.000000
a= 4.05    -3.696934      16.610000
a= 4.10    -3.691228      17.230000
a= 4.15    -3.676476      17.870000
a= 4.20    -3.653888      18.520000
a= 4.25    -3.624569      19.190000
a= 4.30    -3.589560      19.880000



[ Last edited by xiaowu787 on 2010-10-25 at 17:25 ]
9楼2010-10-25 17:22:41
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查看全部 14 个回答

1003307944

银虫 (小有名气)

★
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bingmou:什么意思? 2010-10-21 19:44:43
除非你一个人用超算计算机
3楼2010-10-21 17:03:47
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cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

老和山猥琐派九段

优秀版主

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
bingmou(金币+1):感谢交流 2010-10-21 19:44:07
先学习一下linux的的基本操作。运行脚本,首先要保证脚本有执行权限
$chmod 777 filename
$./filename
4楼2010-10-21 17:06:50
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1003307944

银虫 (小有名气)

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zzy870720z(金币+1):谢谢指教 2010-10-22 08:22:05
你这个脚本执行的时候可能会算,但是有多人提交任务的时候,你的任务会被停止,,还不如把这个脚本中对参量的改变,采用手动的方式,算完一个,再变动下。。
5楼2010-10-21 21:09:14
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