应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » 【求助】关于蛋白或者氨基酸柔性问题
51/1返回列表
查看: 1708  |  回复: 3
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

weipiaoxue

银虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】关于蛋白或者氨基酸柔性问题 已有3人参与

在PDB文件中，可以找到B因子，也就是温度系数，这个系数可以用来反应蛋白质的柔性，我想知道还有没有别的参数可以用来反应蛋白或者说是氨基酸的柔性呢？
  谢谢！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2010-10-21 11:10:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

weipiaoxue

银虫 (初入文坛)
引用回帖:
Originally posted by zh1987hs at 2010-10-21 23:03:45:

反映氨基酸柔性的参数在分子动力学模拟中可用RMSF

谢谢你给我的回答！
    得到的RMSF数值一般都是拿来和B因子做相互验证，感觉上和直接以B因子做柔性指标差不多，在晶体数据库中直接得来的一些参数，很多不理解是干什么的，比如说R因子，自由R因子，RMS，一些角度啊什么的，这些参数里还有是可以体现柔性的吗？ 看过之后感觉只是用来理解得到的晶体是否可信，不知道是不是理解错误了
赞一下 回复此楼
4楼2010-10-22 09:39:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 4 个回答

zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-10-22 09:24:43
引用回帖:
Originally posted by weipiaoxue at 2010-10-21 11:10:37:
在PDB文件中，可以找到B因子，也就是温度系数，这个系数可以用来反应蛋白质的柔性，我想知道还有没有别的参数可以用来反应蛋白或者说是氨基酸的柔性呢？
  谢谢！

反映氨基酸柔性的参数在分子动力学模拟中可用RMSF
赞一下(2人) 回复此楼
3楼2010-10-21 23:03:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 4 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:15 by XQNyDCa1Tk5n
[考博] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 22:11 by XQNyDCa1Tk5n
[基金申请] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:06 by XQNyDCa1Tk5n
[教师之家] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 (EPI+-1)(金币-50) +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 22:06 by XQNyDCa1Tk5n
[有机交流] OpenAI又攻克数学难题了，离AI做有机合成还有多远？ +3 wangyl_123 2026-10-10 6/300 2026-10-11 15:04 by Abin0406
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 (EPI+-1)(金币-50) +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 14:25 by VOMexwnDzOFZ
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 14:13 by VOMexwnDzOFZ
[教师之家] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 (EPI+-1)(金币-50) +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 14:05 by VOMexwnDzOFZ
[考研] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 13:51 by VOMexwnDzOFZ
[硕博家园] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 13:45 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:54 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:53 by VOMexwnDzOFZ
[公派出国] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 10:53 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:34 by VOMexwnDzOFZ
[考博] 招收博士生一名 +3 mandolin 2026-10-10 3/150 2026-10-11 10:21 by 不是山谷！
[教师之家] 课题组会帮你通过考核么？ +3 好运来～9527 2026-10-10 5/250 2026-10-11 09:00 by 好运来～9527
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 4/200 2026-10-11 03:14 by M0zrYVSAnxpE
[有机交流] 各位大佬，路线设计求助 +6 zapen 2026-10-08 8/400 2026-10-10 15:59 by zapen
[基金申请] 入职后第一次管课题组的专利缴费，对账才发现官费比别人多掏了一倍 +5 13108017953 2026-10-08 5/250 2026-10-10 11:15 by wdwd123
[有机交流] 我应该选哪条合成路线让实验成功率高一些？ +5 jing816y 2026-10-08 9/450 2026-10-10 09:05 by zapen
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭