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mazhayazi

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】用DS做3D -qsar parmacophore的完整流程已有5人参与

初学ds,重复了一篇用catalyst做药效团的文章,训练集参数很接近,可是测试集有很大差别,想问下各位大侠,你们用ds做parmacophore一般流程是什么
我是这样做的1.用chemdrow画出结构,mm2优化
            2用ds的tool添加charm立场
            3能量最小化
            4用3d qsar parmacophore generation产生药效团
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shaye

金虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
1楼: Originally posted by mazhayazi at 2010-10-18 16:25:12:
初学ds,重复了一篇用catalyst做药效团的文章,训练集参数很接近,可是测试集有很大差别,想问下各位大侠,你们用ds做parmacophore一般流程是什么
我是这样做的1.用chemdrow画出结构,mm2优化
            2用d ...

这个初次接触,感觉难以下手
做自己,就快乐
11楼2012-03-01 13:00:51
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