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maoalbert

新虫 (小有名气)

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[交流] 【求助】纳米管道边界问题已有2人参与

请教一下，我在用MD模拟高分子在纳米管道中的运动时，珠子的力好像特别大，以至于一下子就跑到了管道外边，在X和Y方向我用了周期性边界条件，但是在Z方向是非周期性的，我是用Fortran自己编程的，不知道该怎样限制Z方向的位移。我想用反射的原理去做，可是反射一次的话如果还是在外边怎么办，这个已经困惑我好多天了，希望能够得到各位大侠的帮助。先谢谢了！

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1楼2010-10-10 12:23:42

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maoalbert

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引用回帖:

Originally posted by zyj8119 at 2010-10-11 08:22:29:

[code]c    standard cubic boundary conditions


      aaa=1.d0/cell(1)

      do i=iatm1,iatm2
      xxx(i)=xxx(i)-cell(1)*nint(aaa*xxx(i))
      yyy(i)=yyy( ...

好的，谢谢您了！非常感谢！我看看先！