应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Monte Carlo » 【求助】纳米管道边界问题
51/1返回列表
查看: 880  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

maoalbert

新虫 (小有名气)

[交流] 【求助】纳米管道边界问题 已有2人参与

请教一下，我在用MD模拟高分子在纳米管道中的运动时，珠子的力好像特别大，以至于一下子就跑到了管道外边，在X和Y方向我用了周期性边界条件，但是在Z方向是非周期性的，我是用Fortran自己编程的，不知道该怎样限制Z方向的位移。我想用反射的原理去做，可是反射一次的话如果还是在外边怎么办，这个已经困惑我好多天了，希望能够得到各位大侠的帮助。先谢谢了！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
1楼 2010-10-10 12:23:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

maoalbert

新虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by zyj8119 at 2010-10-11 08:22:29:


[code]c     standard cubic boundary conditions
        
        
        aaa=1.d0/cell(1)

        do i=iatm1,iatm2
          xxx(i)=xxx(i)-cell(1)*nint(aaa*xxx(i))
          yyy(i)=yyy( ...

好的，谢谢您了！非常感谢！我看看先！
赞一下 回复此楼
6楼2010-10-11 09:31:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

zyj8119

木虫 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zh1987hs(金币+2):谢谢 2010-10-10 18:51:23
是参考FRENKEL的那本书吗？你的这个可以看看lammps或者 DLPOLY的源代码,对于Z方向，可以用nint()函数取整，使得跑出盒子的分子跳进去？
赞一下(2人) 回复此楼
好好学习，天天向上。
2楼2010-10-10 12:55:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

maoalbert

新虫 (小有名气)
★
zh1987hs(金币+1):鼓励交流 2010-10-10 18:51:33
引用回帖:
Originally posted by zyj8119 at 2010-10-10 12:55:36:
是参考FRENKEL的那本书吗？你的这个可以看看lammps或者 DLPOLY的源代码,对于Z方向，可以用nint()函数取整，使得跑出盒子的分子跳进去？

我没注意看Frenkel那本书，我只有中文版的，不知道哪里能得到DLPOLY的源代码，我不明白用nint()取整就可以跳回来么？能否解释的详细点，呵呵，我是新手。谢谢回复！
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2010-10-10 16:24:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zyj8119

木虫 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-10-11 09:28:29
引用回帖:
Originally posted by maoalbert at 2010-10-10 16:24:57:


我没注意看Frenkel那本书，我只有中文版的，不知道哪里能得到DLPOLY的源代码，我不明白用nint()取整就可以跳回来么？能否解释的详细点，呵呵，我是新手。谢谢回复！

DLPOLY的源代码，只要你与他们科研组联系，得到账号就可以了。
赞一下(2人) 回复此楼
好好学习，天天向上。
4楼2010-10-11 08:19:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿华中科技大学071000，求调剂 +4 沿岸有贝壳6 2026-03-21 4/200 2026-03-22 07:21 by ilovexiaobin
[考研] 一志愿西安交通大学材料工程专业 282分求调剂 +10 枫桥ZL 2026-03-18 12/600 2026-03-21 22:02 by peike
[考研] 一志愿南大，0703化学，分数336，求调剂 +3 收到VS 2026-03-21 3/150 2026-03-21 18:42 by 学员8dgXkO
[考研] 278求调剂 +9 烟火先于春 2026-03-17 9/450 2026-03-21 17:47 by 学员8dgXkO
[考研] 材料 271求调剂 +5 展信悦_ 2026-03-21 5/250 2026-03-21 17:29 by 学员8dgXkO
[考研] 材料与化工（0856）304求 B区 调剂 +3 邱gl 2026-03-21 3/150 2026-03-21 13:47 by lature00
[考研] 求调剂 +6 Mqqqqqq 2026-03-19 6/300 2026-03-21 08:04 by JourneyLucky
[考研] 材料工程（专）一志愿985 初试335求调剂 +3 hiloiy 2026-03-17 4/200 2026-03-21 03:04 by JourneyLucky
[考研] 324分 085600材料化工求调剂 +4 llllkkkhh 2026-03-18 4/200 2026-03-21 01:24 by JourneyLucky
[考研] 311求调剂 +5 冬十三 2026-03-18 5/250 2026-03-21 00:16 by JourneyLucky
[考研] 294求调剂材料与化工专硕 +15 陌の森林 2026-03-18 15/750 2026-03-20 23:28 by JourneyLucky
[考研] 330求调剂 +4 小材化本科 2026-03-18 4/200 2026-03-20 23:13 by JourneyLucky
[考研] 317求调剂 +5 申子申申 2026-03-19 9/450 2026-03-20 22:26 by JourneyLucky
[考研] 085600材料与化工 +8 安全上岸！ 2026-03-16 8/400 2026-03-20 22:13 by luoyongfeng
[考研] 288求调剂，一志愿华南理工大学071005 +5 ioodiiij 2026-03-17 5/250 2026-03-19 18:22 by zcl123
[考研] 材料专硕306英一数二 +10 z1z2z3879 2026-03-16 13/650 2026-03-18 14:20 by 007_lilei
[考博] 26博士申请 +3 1042136743 2026-03-17 3/150 2026-03-17 23:30 by 轻松不少随
[硕博家园] 湖北工业大学 生命科学与健康学院-课题组招收2026级食品/生物方向硕士 +3 1喜春8 2026-03-17 5/250 2026-03-17 17:18 by ber川cool子
[考研] 302求调剂 +4 小贾同学123 2026-03-15 8/400 2026-03-17 10:33 by 小贾同学123
[考研] 0856求调剂 +3 刘梦微 2026-03-15 3/150 2026-03-16 10:00 by houyaoxu
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭