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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】各位高手如何整理高斯结果的？
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hxy366

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】各位高手如何整理高斯结果的？ 已有4人参与

想把结果中某些相同类型的信息复制到一起以便查看，手动操作很麻烦，有什么快点的方法没有？例如：优化过程中如果想把每次优化的收敛判定结果整理到一起以方便比较优化时的变化，如下：
Maximum Force            0.052228     0.000450     NO
RMS         Force            0.005206     0.000300     NO
Maximum Displacement     0.339187     0.001800     NO
RMS         Displacement     0.037789     0.001200     NO

Maximum Force            0.026208     0.000450     NO
RMS         Force            0.002725     0.000300     NO
Maximum Displacement     0.071226     0.001800     NO
RMS         Displacement     0.012833     0.001200     NO

Maximum Force            0.005001     0.000450     NO
RMS        Force            0.000729     0.000300     NO
Maximum Displacement     0.067965     0.001800     NO
RMS         Displacement     0.014147     0.001200     NO


高斯计算结果中有许多不想要的信息，怎么快速的把它们滤掉？
有什么好用的结果整理软件或操作方法，请高手们赐教，谢谢!
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1458238025==
1楼 2010-10-09 09:59:52
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pwzhou

铁杆木虫 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zhou2009(金币+2): 2010-10-09 12:05:33
装cygwin或者mingw，里面有grep
下图是windows下mingw（安装了MSYS）的截图：
引用回帖:
Originally posted by hxy366 at 2010-10-09 10:56:11:
悲剧的是我在Windows下
有什么对应的方法没?
赞一下(2人) 回复此楼
6楼2010-10-09 11:55:25
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pwzhou

铁杆木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zhou2009(金币+3): 2010-10-09 12:04:21
这个很简单，在Linux下用grep命令就可以实现：
grep -A 4 "Converged" $output  

$output代表Gaussian输出文件的名称



顺便再提供一个脚本，这个脚本可以检测优化过程已经进行了几步以及当前的收敛状态：
CODE:
#!/bin/sh

if [ $# -ne 1 ]
then
        echo "Usage: $0 Gaussian output file"
        exit 1
fi

if [ ! -e $1 ]
then
        echo "$1 not existed!"
        exit 1
fi

scf_iters=`grep "Converged" $1 | wc -l`
echo ""
echo -e "The SCF has runned for \033[45m\033[5m $scf_iters \033[0m cycles"

echo ""
echo "The converged codition is:"
grep -A 4 "Converged" $1 | tail -4
echo ""

执行结果：
引用回帖:
Originally posted by hxy366 at 2010-10-09 09:59:52:
想把结果中某些相同类型的信息复制到一起以便查看，手动操作很麻烦，有什么快点的方法没有？例如：优化过程中如果想把每次优化的收敛判定结果整理到一起以方便比较优化时的变化，如下：
Maximum Force          ...

[ Last edited by pwzhou on 2010-10-9 at 10:28 ]
赞一下(2人) 回复此楼
2楼2010-10-09 10:22:07
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manson1998

金虫 (著名写手)

OLED达人
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
如果你在linux下的话 直接用grep命令就可以了。 饿刚没看见楼上已经有人回复了，哀哉
赞一下(1人) 回复此楼
惺惺相惜情不自禁
3楼2010-10-09 10:22:07
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hxy366

金虫 (小有名气)
悲剧的是我在Windows下
有什么对应的方法没?
引用回帖:
Originally posted by pwzhou at 2010-10-09 10:22:07:
这个很简单，在Linux下用grep命令就可以实现：
grep -A 4 "Converged" $output  

$output代表Gaussian输出文件的名称



顺便再提供 ...

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1458238025==
4楼2010-10-09 10:56:11
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