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thh2008

铜虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】完整ORF判断的软件已有7人参与

请问一下大家,有没有哪个网址或软件可以判断所克隆的ORF是否是完整的?谢谢!
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yixuanwin

铁杆木虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by brightfuture01 at 2010-10-14 22:04:48:
这个图的意思是:

在判定ORF时,因为序列方向的不定性,所以程序会从正反两端做查找。

根据密码子的三联体特性,所以查找时会移码查找,以下面这段序列为例

aatttaaaaatttaattt正向有三个起始法:aat,at ...

图的左右 不是对应的么?
10楼2010-10-15 09:30:29
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查看全部 17 个回答

brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)

我爱打老虎

文献杰出贡献

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
1949stone(金币+1):鼓励 2010-10-16 19:10:33
Google里面搜索 ORFinder ,我最喜欢用的是这个。
The world is a fine place and worth fighting for. I agree with the second part.
2楼2010-10-08 16:28:35
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thh2008

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
Originally posted by brightfuture01 at 2010-10-08 16:28:35:
Google里面搜索 ORFinder ,我最喜欢用的是这个。

请问用这个查找了之后,怎么判定它就是complate CDS呢?
4楼2010-10-13 17:43:32
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brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)

我爱打老虎

文献杰出贡献


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
根据起始密码子和终止密码子确定。
The world is a fine place and worth fighting for. I agree with the second part.
5楼2010-10-13 20:21:33
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