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小丁山

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】如何确定一段基因的位置在染色体还是在质粒上? 已有8人参与

一株刚刚筛出来的干酪乳杆菌,想确定其产胞外多糖基因的位置是否位于质粒,望高手指点
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rtli1672

金虫 (著名写手)

质粒提出来做PCR


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
可以分别提取质粒和基因组DNA,分别作PCR检测就可以了
2楼2010-09-26 09:48:46
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小丁山

铜虫 (小有名气)

[quote]Originally posted by rtli1672 at 2010-09-26 09:48:46:
可以分别提取质粒和基因组DNA,分别作PCR检测就可以了
如何检测呢,是以什么作为模板

[ Last edited by 小丁山 on 2010-9-26 at 09:55 ]
3楼2010-09-26 09:54:25
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rtli1672

金虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
按照你要检测的那个基因序列设计引物,分别以质粒和基因组DNA为模板,做PCR,产物进行琼脂糖凝胶电泳,有目的带的就是有基因的部分。当然,如果你实验室条件允许的话,也可以直接把质粒或DNA送去公司测序,测序引物用你自己的特异引物就行了
4楼2010-09-26 10:06:07
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banhf

新虫 (初入文坛)

★ ★
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silicare(金币+1): 2010-09-27 11:58:03
据我所知,有时提取质粒时会有少量基因组DNA也被提取出来。
因为我们知道理论上只要有一条模板链就可以得到PCR产物,怎么保证提取出的质粒绝对不包含基因组DNA呢?求解
5楼2010-09-27 10:48:14
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shan-sa

金虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
做SOUTHERN杂交,定位看看就知道了
6楼2010-09-27 11:07:06
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zking5129

铁虫 (初入文坛)


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貌似有质粒消除实验,虽然没做过,不过楼主可以尝试一下。
7楼2010-09-28 15:04:01
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06052105

木虫 (正式写手)


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同位素标记法试一下!!

和自己的昨天比,只要有进步就行。天很宽,地很广,别人有路我有桥!
8楼2010-09-28 16:22:33
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小丁山

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by shan-sa at 2010-09-27 11:07:06:
做SOUTHERN杂交,定位看看就知道了

那以什么作为模板进行杂交 这产糖基因还是未知呢 如何杂交啊
9楼2010-10-10 13:51:56
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shan-sa

金虫 (正式写手)


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哦,如果基因未知就没有办法做探针了...
10楼2010-10-10 14:12:22
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