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【求助】请教各位几个问题
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因为对量化计算的兴趣,想将其引入自身的实验中: 体系主要是含金属离子或不含金属离子的酶体系,活性位点已知(3个氨基酸,大约20+原子)底物约10+原子,若想: 1.通过量化计算获得金属离子的参数用于分子动力学计算,如NAMD,是否可行? 2.利用量化计算获知哪种底物可能能与活性残基反应,是否能通过能量计算给出推断? 3.能否对反应机制给予解释?是否涉及推测过渡态? 以上这些设想是否能利用免费量化软件,如ORCA2.8或GAMESS完成而不需要通过GAUSSIAN? |
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2楼2010-09-19 01:18:24
coolrainbow
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