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wwgaochao

铜虫 (正式写手)

[交流] 【求助】CASTEP中的参数设置问题

想做单晶硅中的一些缺陷的第一性原理计算，例如在64原子的超胞中掺杂进一个杂质原子，计算杂质原子和空位的相互作用。请问用CASTEP计算时（如Geompt）该怎么确定Ecutoff、k-point等参数？除了这些参数外还有还有哪些参数对结果影响较大需要修正？
另外，有些文献中说为避免超胞内的杂质相互作用会把边界原子固定住，这是什么道理？固定时是把Fractional XYZ和卡迪尔坐标系都固定住吗？
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1楼 2010-09-16 16:51:22
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solarman

新虫 (正式写手)
★ ★
aylayl08(金币+2):感谢回复讨论 2010-09-16 18:30:12
wwgaochao(金币+8):谢谢解答，但还是不明白Ecut和k-point的选择... 2010-09-16 19:25:13
其实你选取默认的精度质量ultrafine，已经能高度精确的满足你对Ecut和Kpoint的要求。你若是机器质量不佳，对于这么大的体系，kpoint选取1*1*1都没关系。
此外，交换关联势的选取，赝势的选择都会在一定程序上影响你的结果，这取决于你计算的体系。
把边界原子固定不仅仅是为了避免包内杂质相互作用，更重要的是避免在优化的过程中有原子损失。
最后，你选取笛卡尔坐标固定即可。
祝你好运！

[ Last edited by solarman on 2010-9-16 at 18:06 ]
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2楼2010-09-16 18:02:24
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solarman

新虫 (正式写手)
★ ★
zzy870720z(金币+2):谢谢指教 2010-09-16 20:39:54
wwgaochao(金币+6):谢谢您的解答，我明白了，还有点问题想向您请教^_^ 2010-09-16 22:22:16
引用回帖:
Originally posted by wwgaochao at 2010-09-16 16:51:22:
想做单晶硅中的一些缺陷的第一性原理计算，例如在64原子的超胞中掺杂进一个杂质原子，计算杂质原子和空位的相互作用。请问用CASTEP计算时（如Geompt）该怎么确定Ecutoff、k-point等参数？除了这些参数外还有还有哪 ...

你若想确定最好的（同时效率最高的）Ecut和K，可以这样做：
做一个图，横坐标为Ecut，纵坐标为总能量，让Ecut由小变大，最终你会发现一个临界Ecut0，超过这个值后，体系总能的改变可以忽略不计。那么你就选取Ecut0即可同时保证精度和效率。
同理，K可以确定。
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3楼2010-09-16 19:47:30
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wwgaochao

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by solarman at 2010-09-16 19:47:30:


你若想确定最好的（同时效率最高的）Ecut和K，可以这样做：
做一个图，横坐标为Ecut，纵坐标为总能量，让Ecut由小变大，最终你会发现一个临界Ecut0，超过这个值后，体系总能的改变可以忽略不计。那么你就选取 ...

谢谢您的解答，我明白了，但是还有个问题，当对一种缺陷（如一个杂质原子和它的最近邻空位）确定了E和K后，对第二种缺陷（如那个杂质原子和它的第二近邻空位）还要重新确定吗？
再追问个问题，在什么情况下需要固定住边界原子？
不好意思，我实在是太小白了
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4楼2010-09-16 23:04:05
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wwgaochao

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by solarman at 2010-09-16 19:47:30:


你若想确定最好的（同时效率最高的）Ecut和K，可以这样做：
做一个图，横坐标为Ecut，纵坐标为总能量，让Ecut由小变大，最终你会发现一个临界Ecut0，超过这个值后，体系总能的改变可以忽略不计。那么你就选取 ...

不好意思，再向您请教一下，如您所说的方法去确定E和K时，都需要先固定住其中一个变量E或K。如做总能和Ecut的关系图时，必须先固定住K，而k也有很多取值，是否要对这时也要对k一一取值？（比如在k取1*1*1时需要把E值取一遍，在k取2*2*2时同样也要把E值却一遍？）
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5楼2010-09-17 08:18:56
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Janboma

捐助贵宾 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by wwgaochao at 2010-09-16 16:51:22:
想做单晶硅中的一些缺陷的第一性原理计算，例如在64原子的超胞中掺杂进一个杂质原子，计算杂质原子和空位的相互作用。请问用CASTEP计算时（如Geompt）该怎么确定Ecutoff、k-point等参数？除了这些参数外还有还有哪 ...

受教了
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6楼2010-09-17 13:07:50
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awmc2008

至尊木虫 (文坛精英)

学习者
谢谢高手。
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xuexizhe
7楼2010-09-17 20:29:40
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锐利的碎片

木虫 (正式写手)

star watcher
wwgaochao(金币+2):嗯，好的，我试试，还有个小问题... 2010-09-17 20:55:39
引用回帖:
Originally posted by wwgaochao at 2010-09-17 08:18:56:

不好意思，再向您请教一下，如您所说的方法去确定E和K时，都需要先固定住其中一个变量E或K。如做总能和Ecut的关系图时，必须先固定住K，而k也有很多取值，是否要对这时也要对k一一取值？（比如在k取1*1*1时需要 ...

你先取个比较大K点的算截断，再把K点降下来。
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8楼2010-09-17 20:35:15
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wwgaochao

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by 锐利的碎片 at 2010-09-17 20:35:15:

你先取个比较大K点的算截断，再把K点降下来。

64个原子的硅超胞，里边一个替位的Sn原子和一个空位，边界原子固定住Cartesian坐标，用8核服务器大约要算多长时间呢？我的算了近10个小时了还一点反应都没有...
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9楼2010-09-17 20:57:55
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磊俊陈

木虫 (小有名气)
学习了
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以一颗学习的心态面对一切未知的事物！
10楼2013-04-15 10:11:08
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