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zhaicatty

木虫 (小有名气)

[交流] 【求助】ATK计算双电极体系的总能量已有1人参与

听前辈说在进行双电极系统的优化前,可以先设定一系列分子到电极的距离d,计算一个能量-距离(E-d)曲线,得到对应最低能量的距离作为分子到电极的平衡距离,再对这个距离的体系进行优化。
我试图按照这样的方法找到对应最低能量的分子—电极距离,但是发现即使不改变分子—电极间距,保持所有的参数条件都不变,计算体系的能量,结果每次结果都不同,有的时候还相差挺大的。使得计算出来的每组E-d曲线都不同。不知道这是什么原因?

菜鸟初学,请高手指教!

[ Last edited by zhaicatty on 2010-9-9 at 21:35 ]
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哲人无忧,智者常乐。不是因为所爱的一切他都拥有了,而是所拥有的一切他都爱。
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zhaicatty

木虫 (小有名气)


163.com(金币+1):谢谢回帖交流…… 2010-09-10 12:30:10
谢谢。

如楼上前辈所言,是不是先用其它软件优化中间散射区,再把中间散射区放到ATK里,构成双电极系统,计算传输?
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3楼2010-09-10 09:49:55
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zhaicatty

木虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by gaottgougou at 2010-09-10 17:09:21:


我经常这样处理一些问题,但是你还是要仔细考虑电极与分子间距离d的问题。
我觉得如果你不考虑电极与分子间的相互作用,这个问题还是很简单的,就是将你的分子和电极做成ATK中的bulk(ATK计算bulk能量还是可 ...

谢谢你,我会照你的方法试试看
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5楼2010-09-10 22:59:53
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zhaicatty

木虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by 椰浆饭 at 2010-09-11 10:01:30:


是不是你的SCF没收敛?

应该收敛了,计算都是正常结束的,没有任何错误提示,并给出了总能量的值。
如果不收敛的话,应该会有提示的,对吧?
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7楼2010-09-11 15:00:46
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zhaicatty

木虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by fan159 at 2010-09-15 18:43:56:
不应该出现这样的问题啊,如果按你说的什么都没改变,而每次能量相差较大的话,这不是说程序不可信吗?如果一模一样的设置,然而程序都是一样的算法,应该是得到一致的结果才对

确实是这样,所以才郁闷呢?!
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9楼2010-09-16 10:24:37
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zhaicatty

木虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by liwl926 at 2010-09-16 20:57:38:

这种情况可以理解,毕竟如果机器不同,如位数不同的话,用来存取数据的字节也不同,这就造成了精度上的变化,也可以认为是误差。但同一机器,同一设置出现这种情况人为错误的可能性比较大!

那我重新再做一次,看看是不是我操作有问题。
谢谢楼上各位前辈的指点
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12楼2010-09-17 09:48:39
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