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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » 【求助】请问如何将多条swiss model 建模结果拼凑起来以覆盖整条氨基酸序列？
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whoisthis

铁虫 (小有名气)

[交流] 【求助】请问如何将多条swiss model 建模结果拼凑起来以覆盖整条氨基酸序列？ 已有2人参与

请问如何将多条swiss model 建模结果拼凑起来以覆盖整条氨基酸序列？
不同区域的建模结果能覆盖整条蛋白序列，但是怎么将它们拼凑起来呢？
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1楼 2010-09-08 16:27:09
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whoisthis

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by zh1987hs at 2010-09-08 21:13:50:

你这个不同区域指的是一个多组分酶的不同亚基吗？如果是这个样的话需要用ZDOCK或者HEX将其对接起来，但是准确程度不能保证，最好有晶体结构作为参照

我这个蛋白是一个跨膜蛋白，有两个主要的功能区。
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3楼2010-09-09 10:24:59
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zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手
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lei0736(金币+2):谢谢 2010-09-09 09:11:02
引用回帖:
Originally posted by whoisthis at 2010-09-08 16:27:09:
请问如何将多条swiss model 建模结果拼凑起来以覆盖整条氨基酸序列？
不同区域的建模结果能覆盖整条蛋白序列，但是怎么将它们拼凑起来呢？
高人指点一下

你这个不同区域指的是一个多组分酶的不同亚基吗？如果是这个样的话需要用ZDOCK或者HEX将其对接起来，但是准确程度不能保证，最好有晶体结构作为参照
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2楼2010-09-08 21:13:50
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zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-09-09 12:01:39
引用回帖:
Originally posted by whoisthis at 2010-09-09 10:24:59:



我这个蛋白是一个跨膜蛋白，有两个主要的功能区。

跨膜蛋白倒是真没做过，具体的你可能得参考相关文献了~不过不同功能区的结果并不能简单的拼接起来~
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4楼2010-09-09 10:53:30
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