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saradzj银虫 (小有名气)
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【求助】怎样判断优化后的构型是稳定的、合理的?
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我是采用chem 3D来构建初始结构的,首先是采用的chem draw画出分子结构,然后再复制到chem 3D里面得到立体结构,再采用mopac预优化,最后采用PM3进行优化得到稳定构型的,可是现在遇到一个问题:就是我自己画出来的结构与直接从chem draw里面采用名称得到的结构最终优化好的构型是不一致的,并且能量也存在差异,但是我将两个结构都算了频率,都是没有虚频的。 那我应该如何来选择哪个是最稳定的啊,或者我这种方法本身存在问题,请知道的高手指点一下,不胜感激! |
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5楼2010-09-06 09:54:49
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