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saradzj

银虫 (小有名气)

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[交流] 【求助】怎样判断优化后的构型是稳定的、合理的？

我是采用chem 3D来构建初始结构的，首先是采用的chem draw画出分子结构，然后再复制到chem 3D里面得到立体结构，再采用mopac预优化，最后采用PM3进行优化得到稳定构型的，可是现在遇到一个问题：就是我自己画出来的结构与直接从chem draw里面采用名称得到的结构最终优化好的构型是不一致的，并且能量也存在差异，但是我将两个结构都算了频率，都是没有虚频的。
那我应该如何来选择哪个是最稳定的啊，或者我这种方法本身存在问题，请知道的高手指点一下，不胜感激！

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1楼 2010-09-05 15:33:58

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saradzj

银虫 (小有名气)

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引用回帖:

Originally posted by noeyedragon at 2010-09-06 11:03:09:
区长很高。楼主的结构肯定是含有n多个可能的构象。初学小弟从实践中的经验看看是否有助于你：1如果能够用Gaussianview作出平面图，作出平面图进行结构优化。2如果不能用高斯view作出平面图，就用它作出几种楼主认 ...

恩，谢谢，我再用Gaussian View作图看看~！