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【求助】势能为正值
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shengxiang
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【求助】势能为正值
请教个问题,跑完动力学之后我用e_energy分析势能随时间的变化时发现势能都是正的,这怎么解释啊?
势能图如下:
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1楼
2010-09-02 10:45:00
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shengxiang(金币+1): 2010-09-05 08:29:41
lei0736(金币+2):谢谢 2010-09-05 09:33:16
引用回帖:
Originally posted by
shengxiang
at 2010-09-03 21:39:31:
是这样的,我的体系中只有醇,我算的这个势能是用GROMACS中的g_energy选择势能“potentia”,我看文献中求出的势能都是负的~这个势能是以什么为标准呢?可能是正的吗?请不吝赐教~万分感谢~l
最简单的LJ势能就可以是正值
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10楼
2010-09-04 14:34:16
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lei0736(金币+1):谢谢 2010-09-02 19:46:09
shengxiang(金币+5): 2010-09-03 21:36:01
你跑的是个什么体系?我从前跑过肽段,得到的势能也是正值,是没有问题的 不过看你的势能值貌似也太高了点了啊 是不是计算方面有什么错误呢~
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2楼
2010-09-02 16:37:45
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lei0736(金币+2):谢谢 2010-09-02 19:46:16
shengxiang(金币+5): 2010-09-03 21:36:08
引用回帖:
Originally posted by
shengxiang
at 2010-09-02 10:45:00:
请教个问题,跑完动力学之后我用e_energy分析势能随时间的变化时发现势能都是正的,这怎么解释啊?
你可以先考虑下这个问题:
势能为什么不能是正的?
然后是:
你模拟的体系中势能由哪些部分组成?
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3楼
2010-09-02 17:23:27
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lei0736(金币+2):谢谢 2010-09-02 22:10:43
shengxiang(金币+1): 2010-09-03 21:36:13
看一下这个帖子
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2297056
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4楼
2010-09-02 20:32:45
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