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天下枫叶

木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】结构模拟与计算

我想做一个β-环糊精包结物的模型并进行能量计算,但不知道怎么构建,如各自结构怎么导入,我试了从chem3D中导入,但不能计算,请高手指点,谢谢啊
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主

引用回帖:
Originally posted by 天下枫叶 at 2010-08-30 23:12:26:

那是不是必须从gaussianview里画图的,有文献说可以从CCDB里导出,不知道你会不

人家那是ccdc好伐,不是ccdb啊……碎碎念……囧……撞墙
不仅仅是ccdc可以导出,而且还可以从icsd导出。

ccdc或icsd---导出cif---打开ms重构晶体--存为通用格式--gv

ccdc或icsd---导出cif---打开mercury存为通用格式--gv

[ Last edited by yjcmwgk on 2010-8-31 at 08:20 ]
5楼2010-08-31 08:19:22
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noeyedragon

金虫 (正式写手)

★ ★
erylingjet(金币+2):感谢交流,辛苦了! 2010-08-30 19:07:48
gaussianview的3d绘图不比chem3D弱。2d可能弱点。,office和高斯有点不和谐,office 导入的结构到高斯有时就是有问题。
2楼2010-08-30 13:24:13
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天下枫叶

木虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by noeyedragon at 2010-08-30 13:24:13:
gaussianview的3d绘图不比chem3D弱。2d可能弱点。,office和高斯有点不和谐,office 导入的结构到高斯有时就是有问题。

那是不是必须从gaussianview里画图的,有文献说可以从CCDB里导出,不知道你会不
3楼2010-08-30 23:12:26
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xjyuefan

铁杆木虫 (正式写手)

会不会是孤对电子没有删掉?chem3D中设定好路径就可以直接设置gaussian计算,不用导出了。不过计算时会慢。
4楼2010-08-30 23:16:26
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