24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
查看: 2112  |  回复: 8
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

芥末蚕豆

铜虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】16s 构建进化树已有7人参与

弱弱的请问:我想构建16s RNA进化树,我在NCBI上检索16s 的基因序列,但好多都是rimM、sun或是其他的一些16S ribosomal RNA 上的一些基因,不是16S ribosomal RNA gene,所以我想知道我到底要下载哪种基因构建进化树啊?好多菌种检索不到16S ribosomal RNA gene 啊!
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

开心就好!
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

芥末蚕豆

铜虫 (初入文坛)

我老师后来告诉我让我到每个菌的基因组上去找!就都可以找到16S!后来试了试,好像还是对的!不过实在是初学,还有好多都有点迷糊!
开心就好!
9楼2010-08-31 18:34:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

千里千寻5801

金虫 (小有名气)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
silicare(金币+1):你的帖子好少啊~ 2010-08-26 17:53:55
先确认你所需要的菌株的序列号,输入你所需要菌株的序列号,在NCBI上就可以下载相应的序列了。
时间蹉跎了我的青春,却也见证了你我的经历!好好珍惜时间,珍惜自己!
2楼2010-08-26 16:19:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pxf983621

铁杆木虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
用那个软件,按步骤来就行啦。
3楼2010-08-26 17:14:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

芥末蚕豆

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
Originally posted by 千里千寻5801 at 2010-08-26 16:19:29:
先确认你所需要的菌株的序列号,输入你所需要菌株的序列号,在NCBI上就可以下载相应的序列了。

那我要是想下这个呢Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida A449,具体能写一下步骤吗?我只能收索到18个相关的基因(rrsA、rrsC、era……)
开心就好!
4楼2010-08-26 17:40:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复(可上传附件)
信息提示
请填处理意见