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Illfxy

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】质粒测序没结果,希望高手们解答! 已有8人参与

小弟,最近在做菌种鉴定,把质粒送到公司测序,结果是好几个重头到尾都读不出,有几个又是到了五六百了就不能读不出了。头一做,就搞成这样。希望大侠们解答!谢谢了!
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探索人类未来的其中一人
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banhf

新虫 (初入文坛)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
菌种鉴定用的是16SrRNA的序列,一般是PCR扩增出16SrDNA,TA克隆之T载体后用通用引物进行测序,不知道你是不是这样的实验流程。
你说的那几个500bp左右就没有信号的峰图可以分析一下乱峰之前的序列,如果这段序列可能形成某种二级结构,或是某个碱基的单一重复,那就会造成测序峰图走不下去,可以尝试用反向引物从另外一个方向测过去。
13楼2010-08-24 12:30:22
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Illfxy

铜虫 (小有名气)

测出来的图

探索人类未来的其中一人
2楼2010-08-23 15:00:00
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Illfxy

铜虫 (小有名气)

探索人类未来的其中一人
3楼2010-08-23 15:00:30
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yujiaping1

木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
这个图好像套峰很严重啊,通用引物用的什么啊?
4楼2010-08-23 15:33:27
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