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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】测序疑问
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tuobaohua

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[交流] 【求助/交流】测序疑问

给测序公司送样品测序，附带了自己的上游引物和下游引物，最后测出来的结果是同一个样品，上游引物和下游引物测出来的碱基隔了300多个（一个1200+，一个900+），现在我要做同源性分析，请问我该怎么办？新手上路，望各位高手不吝赐教！
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1楼 2010-08-19 20:34:31
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zhandeguo1

银虫 (小有名气)

测序问题

tuobaohua(金币+1):恩，准备换到上海生工再测一次的 2010-08-20 08:15:41
tuobaohua(金币+1): 2010-12-19 18:51:53
测序也有很多问题，我们一般是先换个公司测。
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2楼2010-08-19 21:35:51
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xp198766

铁杆木虫 (著名写手)

小木虫职业打酱油滴~~！
tuobaohua(金币+1):恩，谢谢回帖交流，已经基本上搞懂这个东西的原理了！ 2010-08-20 08:14:32
tuobaohua(金币+1):谢谢啦，这个问题已经弄清楚了！ 2010-08-23 19:23:04
tuobaohua(金币+6): 2010-12-19 18:52:10
tuobaohua(金币+1): 2010-12-19 18:52:56
你是让测序公司给你双向测序吗？
是同一个样品送去测序的？
如果不是同一个样品，你想做这两个样品的同源性分析？
还是是一个样品，你想做这个样品的同源性分析？这样的话，可以把样品序列拿到genbank里面比对就行了啊

http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Bl ... ;LINK_LOC=blasthome
注意选择Database
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3楼2010-08-19 21:50:04
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欣晴5832

金虫 (小有名气)
tuobaohua(金币+1):恩，谢谢回帖！ 2010-08-23 19:23:28
tuobaohua(金币+3): 2010-12-19 18:53:06
不知道你测的这段目的基因应该有多长，是哪个基因，有的高度保守，如果亲缘关系很近的话也有可能一样
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4楼2010-08-23 09:59:28
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hxq320

木虫 (正式写手)
tuobaohua(金币+1):恩，换个公司去测的，谢谢回帖！ 2010-08-23 19:23:52
tuobaohua(金币+4): 2010-12-19 18:52:21
可以先把序列在genbank里面作比对，测序时有的碱基测不出来很正常，直接把测出的部分做比对，如果不行可以对未测出的部分设计引物让测序公司在测。
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5楼2010-08-23 10:17:21
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