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sabrina9786

木虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】请教多个蛋白质序列比对显示保守区域的问题

我有4个功能相似的蛋白质序列,都含有多铜离子结合区域,想通过软件比对后,显示出他们之间的保守区域,也就是铜离子结合区域。如下面给出的例子!

想请教各位大侠使用何软件才能做到,谢谢!

[ Last edited by sabrina9786 on 2010-8-20 at 10:24 ]
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xp198766

铁杆木虫 (著名写手)

小木虫职业打酱油滴~~!

sabrina9786(金币+2):谢谢! 2010-08-20 15:44:24
铜离子结合区,是别人把那断区域剪下来的,还是人工的啊,软件只会帮你比较,你再把比较后产生的氨基酸序列放到NCBI里面BLAST,找到哪断为你的铜离子结合区,再把相应区域剪下来就行了……
8楼2010-08-20 10:36:19
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月月大可

木虫 (著名写手)

sabrina9786(金币+1): 2010-08-20 10:00:36
我尝试用DNAman比对,效果挺好。
2楼2010-08-19 23:27:02
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微笑漩涡

新虫 (著名写手)

sabrina9786(金币+1): 2010-08-20 10:00:40
BioEdit对比后的编辑能力较强。
3楼2010-08-20 08:42:45
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sabrina9786

木虫 (小有名气)

楼上两位还是没有说清楚,能否详细说明如何完成操作
4楼2010-08-20 10:02:41
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