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三妹妹

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】引物设计原则说3‘端避开密码子第3位,何解? 已有9人参与

不明白这密码子第3位是什么意思?是不是起始密码为ATG,引物3’ 端就不能是G呢?新手上路,多多指教啊!
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feiye2214

木虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by 三妹妹 at 2010-08-18 14:28:41:
那在引物设计上来说呢?

据2楼分析和你提出的问题,个人觉得是引物设计时的碱基数都不是三的倍数,这样最后的3‘端碱基就避开了哈,呵呵是不是这样的,我自己推测的啊,呵呵
4楼2010-08-18 14:42:25
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sqhnsd

金虫 (正式写手)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
amisking(金币+2):鼓励一个! 2010-08-18 22:08:39
引用回帖:
Originally posted by 三妹妹 at 2010-08-18 14:19:35:
不明白这密码子第3位是什么意思?是不是起始密码为ATG,引物3’ 端就不能是G呢?新手上路,多多指教啊!

Crick对于tRNA能识别几种密码子的现象,提出碱基配对的“摆动学说”:
认为除A-U、G-C配对外,还有非标准配对,I-A、I-C、I-U,并强调密码子的5’端第1、2个碱基严格遵循标准配对,而第3个碱基可以非标准配对,具有一定程度的摆动灵活性。
2楼2010-08-18 14:24:23
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三妹妹

金虫 (小有名气)

那在引物设计上来说呢?
3楼2010-08-18 14:28:41
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feiye2214

木虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
看天(金币+1):鼓励交流 2010-08-19 15:57:06
也有这样的可能,引物的第一个碱基尽量不要是序列上的密码子的第三位,因为不是严格配对的情况下,第一个碱基就不能100%配对哈
楼下高人指点
5楼2010-08-18 14:46:45
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