24小时热门版块排行榜    

查看: 3919  |  回复: 11
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

lgxyz

铜虫 (正式写手)

[交流] 【求助】求将vasp的输出文件转化成xyz坐标的脚本 已有4人参与

各位虫友,哪位有将vasp的输出文件转化成xyz坐标的脚本,能否给一份,不胜感激!
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dxcharlary

专家顾问 (职业作家)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
cenwanglai(金币+1):呵呵,是这样的。一般都想逃避数学运算。而且额启动matlab需要等待10s左右,还需要读入矩阵。呵呵 2010-08-07 12:13:11
晕,contcar里面不是有晶格矢量和分数坐标吗?你把分数坐标矩阵(n*3)乘上格矢矩阵(3*3)得到的就是xyz坐标啊(n*3),用matlab复制粘贴就可以了
10楼2010-08-07 11:28:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 12 个回答

cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

老和山猥琐派九段

优秀版主

lgxyz(金币+10):vtstool是什么 能不能给个链接?谢谢! 2010-08-06 18:59:23
vtstool code里面有perl程序.


pos2xyz.pl 怎么样呢?试试看。

http://theory.cm.utexas.edu/vtsttools/scripts/

[ Last edited by cenwanglai on 2010-8-7 at 11:25 ]
2楼2010-08-06 17:33:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

calos818

木虫 (著名写手)

新人菜鸟


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by lgxyz at 2010-08-06 17:29:49:
各位虫友,哪位有将vasp的输出文件转化成xyz坐标的脚本,能否给一份,不胜感激!

你好,输出文件有好多,CONTCAR里面就分数或卡迪尔坐标,你指的输出为xyz坐标是啥意思
3楼2010-08-07 07:52:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

老和山猥琐派九段

优秀版主


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by calos818 at 2010-08-07 07:52:33:

你好,输出文件有好多,CONTCAR里面就分数或卡迪尔坐标,你指的输出为xyz坐标是啥意思

估计是卡迪尔坐标。
我的POSCAR都是用direct的。有空去看看转换的perl文件的代码就知道细节了。
4楼2010-08-07 09:49:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 面上函评意见出来了,像什么等级? 20+4 Tsingking1 2026-08-27 17/850 2026-09-01 19:51 by 超级无敌华子
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +5 bjdxyxy 2026-08-26 5/250 2026-09-01 17:54 by 小伟大博士
[论文投稿] 小白求助 投论文要求的highlights应该如何写 5+3 l1963982152 2026-08-29 4/200 2026-09-01 09:04 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 麻烦专家们看看评委们的意见(F口面上) +7 gdd2018 2026-08-28 12/600 2026-09-01 08:32 by 尼古拉斯小虫
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +6 叶九微 2026-08-26 6/300 2026-08-31 23:54 by yudaoqian88
[基金申请] 基金未中,这种答复是模板吗? +6 zhaosm1982 2026-08-27 7/350 2026-08-31 21:18 by qdxxmc
[基金申请] 哪位高人中了,把查询到的截图贴出来让我看看,让我长长见识 +6 yuleib84 2026-08-26 7/350 2026-08-31 19:46 by 鱼翔浅底1
[基金申请] 能否申诉? +7 echo8914667 2026-08-30 8/400 2026-08-31 17:00 by yihongxu
[基金申请] 29号明天会评吗 +4 笨笨唐 2026-08-28 4/200 2026-08-31 09:30 by huixian257
[基金申请] 为什么到现在没收到通知? +5 tannykie 2026-08-29 5/250 2026-08-30 21:05 by purplejack
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +7 德尚中行 2026-08-27 8/400 2026-08-30 20:52 by purplejack
[考博] 找导师 +6 yuanjiabao 2026-08-29 7/350 2026-08-30 14:40 by 生科新手
[基金申请] 看板上这么多中的,有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
[基金申请] 为什么 国际(地区)合作与交流项目 没有放榜? 10+3 majunge000 2026-08-26 11/550 2026-08-27 08:42 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 国际合作可查了,中了面上 (EPI+1)(金币+50) +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 牛来!米来!面来! +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
信息提示
请填处理意见