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【求助】gaussian中简正坐标的输出 已有2人参与
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在一篇文章《Vibrational Analysis in Gaussian》中说到“The purpose of this document is to describe how Gaussian calculates the reduced mass, frequencies, force constants, and normal coordinates which are printed out at the end of a frequency calculation.”从这句话看normal coordinates应该在计算频率的时候打印出来了啊，可是不知道哪地方给的是normal coordinates？以H2o为例，计算频率时的部分输出为： (Enter /home/gau03/g03/l716.exe) Dipole =-3.44478646D-17-3.96506834D-17-6.72452773D-01 Polarizability= 4.00613449D-02 3.18281559D-16 5.50808430D+00 1.58802971D-16 1.97181875D-16 2.56587227D+00 HyperPolar =-3.59200065D-17-6.27316867D-18-2.96845704D-16 -1.10949459D-14 7.62420726D-02-3.00230546D-16 -7.01237208D+00-1.56024452D-16 2.91713493D-15 -4.11420102D+00 Full mass-weighted force constant matrix: Low frequencies --- -6.0514 -1.0843 -0.0019 -0.0012 -0.0009 4.5788 Low frequencies --- 2170.0372 4140.0019 4391.0737 Diagonal vibrational polarizability: 0.0000000 0.0418305 0.1108974 Harmonic frequencies (cm**-1), IR intensities (KM/Mole), Raman scattering activities (A**4/AMU), depolarization ratios for plane and unpolarized incident light, reduced masses (AMU), force constants (mDyne/A), and normal coordinates:（这里也显示normal coordinates，但是不知道怎么看，我怎么找不到啊？ 1 2 3 A1 A1 B2 Frequencies -- 2170.0372 4140.0019 4391.0737 Red. masses -- 1.0785 1.0491 1.0774 Frc consts -- 2.9923 10.5941 12.2392 IR Inten -- 7.2379 44.2862 29.9710 Atom AN X Y Z X Y Z X Y Z 1 1 0.00 0.45 0.54 0.00 -0.57 0.42 0.00 0.54 -0.45 2 1 0.00 -0.45 0.54 0.00 0.57 0.42 0.00 0.54 0.45 3 8 0.00 0.00 -0.07 0.00 0.00 -0.05 0.00 -0.07 0.00 谢谢指点。 |
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11楼2010-08-18 11:36:05
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Atom AN X Y Z X Y Z X Y Z 1 1 0.00 0.45 0.54 0.00 -0.57 0.42 0.00 0.54 -0.45 2 1 0.00 -0.45 0.54 0.00 0.57 0.42 0.00 0.54 0.45 3 8 0.00 0.00 -0.07 0.00 0.00 -0.05 0.00 -0.07 0.00 这个就是。例如2号原子的X,Y,Z坐标构成第1种简正坐标的系数为0.00 -0.45 0.54。 你把这里每个振动模式的3*3矩阵排列成9*1就容易看出简正坐标与原先3N坐标的关系了。如第一个简正坐标： 0.00 0.45 0.54 0.00 -0.45 0.54 0.00 0.00 -0.07 [ Last edited by sobereva on 2010-8-1 at 16:18 ] |
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