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saradzj

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】PM3优化的基础上采用6-31G*算单点能得到的结果与PM3下算得的大小次序不一致 已有4人参与

我有A、B两种包结物,对它们我首先是采用了PM3方法进行结构优化,得到A、B两种物质的最稳定结构,它们的能量为A<B,可是在此优化的基础上我又分别采用了B3LYP 6-31G(d)以及HF 6-31G(d)算最稳定结构下的单点能,可是得到的能量却是A>B,并且比较奇怪的是采用PM3方法算得的结合能是负值,而后面的两种算得的结合能是真值。
    有没有哪位高手可以给小妹解释一下这是什么原因导致的,会不会是因为我的最稳定结构还没有找到啊?在此不胜感激!
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heyo_123

至尊木虫 (职业作家)

说说你的体系所含元素!!可能不适宜用PM3
4楼2010-07-30 11:11:32
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heyo_123

至尊木虫 (职业作家)

引用回帖:
Originally posted by saradzj at 2010-07-30 13:00:37:

我体系里面就只有C、H、O三种元素,不过体系有点大的,有两百多个原子。我觉着应该也不是不适合用PM3,因为相似的计算大部分都是采用PM3方法来优化的。可是我就是搞不懂为什么会出现这种状况。

换PM6,RM1。你确定结构合理??有时候,半经验得到的结构很冏rz!!!

[ Last edited by heyo_123 on 2010-7-30 at 15:13 ]
6楼2010-07-30 15:11:19
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heyo_123

至尊木虫 (职业作家)

saradzj(金币+5): 2010-07-30 19:33:18
PM3,AM1是上个世纪的半经验方法,而PM6,RM1是本世纪的半经验方法!!!!
8楼2010-07-30 17:06:35
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heyo_123

至尊木虫 (职业作家)

引用回帖:
Originally posted by saradzj at 2010-07-29 09:41:47:
我有A、B两种包结物,对它们我首先是采用了PM3方法进行结构优化,得到A、B两种物质的最稳定结构,它们的能量为A<B,可是在此优化的基础上我又分别采用了B3LYP 6-31G(d)以及HF 6-31G(d)算最稳定结构下的单点能 ...

要用PM6,RM1 可以用MOPAC
10楼2010-07-30 19:34:43
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