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哈比纳兹

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】请教如何使用Clustalw进行多序列比对? 已有7人参与

请教大虾,我想用Clustalw进行序列比对,可是序列load不进去,什么格式的序列格式才可以?
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xp198766

铁杆木虫 (著名写手)

小木虫职业打酱油滴~~!

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
看天(金币+2):鼓励交流 2010-07-23 18:17:05
一般不是用clustalx进行比对的吗?
bioedit也可以进行序列比对,还能修改序列,比较不错,一般用fasta格式的啊,就是一个>后面加上注释,再空一行后加序列
例如:
>sequence
GCATGACTGGGATCAT
2楼2010-07-23 14:53:08
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xuweitao

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★ ★
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看天(金币+2):鼓励交流 2010-07-23 18:17:23
去:
http://www.ebi.ac.uk/Tools/clustalw2/index.html
输入序列即可,
每个序列用">序列名"开始,下一行开始输入数据。
然后点”run“

运算完了以后下载对比文件即可。
3楼2010-07-23 14:55:57
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henkally

禁虫 (著名写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
看天(金币+1):鼓励交流 2010-07-23 18:17:33
本帖内容被屏蔽

4楼2010-07-23 15:25:46
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fykxy_206

木虫 (正式写手)

★ ★ ★
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看天(金币+2):鼓励分享 2010-07-23 18:17:50
load 不进去,你是不是把文件放到桌面了?这样不行,Clustal 不识别汉字,你把文件直接放到没有汉字的路径的文件夹下就可以在Clustal中打开比对了。
5楼2010-07-23 15:31:55
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aitoku

木虫 (小有名气)

★ ★
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lstt09nk(金币+1):是的 2010-07-26 17:34:48
clustalw比对的文件必须是fasta格式的,其他的格式这个软件不识别!比对之前必须把格式转成fasta的
6楼2010-07-26 15:04:08
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谢谢分享
7楼2012-03-26 16:00:28
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1937mcq

金虫 (初入文坛)

努力后生


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
我想问你们在哪里下载的clustalw,,,跪求!!!
心若向阳,无谓悲伤!
8楼2017-07-22 22:37:58
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