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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】请教如何使用Clustalw进行多序列比对？
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哈比纳兹

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】请教如何使用Clustalw进行多序列比对？已有7人参与

请教大虾，我想用Clustalw进行序列比对，可是序列load不进去，什么格式的序列格式才可以？
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1楼2010-07-23 14:06:04
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aitoku

木虫 (小有名气)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lstt09nk(金币+1):是的 2010-07-26 17:34:48
clustalw比对的文件必须是fasta格式的，其他的格式这个软件不识别！比对之前必须把格式转成fasta的
赞一下(2人) 回复此楼
6楼2010-07-26 15:04:08
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xp198766

铁杆木虫 (著名写手)

小木虫职业打酱油滴~~！
★ ★ ★
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看天(金币+2):鼓励交流 2010-07-23 18:17:05
一般不是用clustalx进行比对的吗？
bioedit也可以进行序列比对，还能修改序列，比较不错，一般用fasta格式的啊，就是一个>后面加上注释，再空一行后加序列
例如：
>sequence
GCATGACTGGGATCAT
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2楼2010-07-23 14:53:08
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xuweitao

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★ ★
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看天(金币+2):鼓励交流 2010-07-23 18:17:23
去：
http://www.ebi.ac.uk/Tools/clustalw2/index.html
输入序列即可，
每个序列用">序列名"开始，下一行开始输入数据。
然后点”run“

运算完了以后下载对比文件即可。
赞一下(2人) 回复此楼
3楼2010-07-23 14:55:57
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henkally

禁虫 (著名写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
看天(金币+1):鼓励交流 2010-07-23 18:17:33
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4楼2010-07-23 15:25:46
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