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【求助/交流】请教如何使用Clustalw进行多序列比对?
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哈比纳兹
新虫
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专业: 药剂学
[交流]
【求助/交流】请教如何使用Clustalw进行多序列比对?
已有7人参与
请教大虾,我想用Clustalw进行序列比对,可是序列load不进去,什么格式的序列格式才可以?
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1楼
2010-07-23 14:06:04
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henkally
禁虫
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看天(金币+1):鼓励交流 2010-07-23 18:17:33
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4楼
2010-07-23 15:25:46
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xp198766
铁杆木虫
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专业: 环境微生物学
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看天(金币+2):鼓励交流 2010-07-23 18:17:05
一般不是用clustalx进行比对的吗?
bioedit也可以进行序列比对,还能修改序列,比较不错,一般用fasta格式的啊,就是一个>后面加上注释,再空一行后加序列
例如:
>sequence
GCATGACTGGGATCAT
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2楼
2010-07-23 14:53:08
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xuweitao
铁杆木虫
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性别: GG
专业: 生物大分子结构与功能
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看天(金币+2):鼓励交流 2010-07-23 18:17:23
去:
http://www.ebi.ac.uk/Tools/clustalw2/index.html
输入序列即可,
每个序列用">序列名"开始,下一行开始输入数据。
然后点”run“
运算完了以后下载对比文件即可。
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3楼
2010-07-23 14:55:57
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fykxy_206
木虫
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专业: 微生物生理与生物化学
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看天(金币+2):鼓励分享 2010-07-23 18:17:50
load 不进去,你是不是把文件放到桌面了?这样不行,Clustal 不识别汉字,你把文件直接放到没有汉字的路径的文件夹下就可以在Clustal中打开比对了。
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5楼
2010-07-23 15:31:55
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