应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】蛋白质建模没有同源模板怎么解决？
52/1返回列表
查看: 2626  |  回复: 11
只看楼主@他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

wxf3454552

金虫 (著名写手)

[交流] 【求助】蛋白质建模没有同源模板怎么解决？已有5人参与

需要得到蛋白质三维结构 但是没有搜索到可用的同源模板  只知道一级序列
这种情况下应该怎么办？麻烦各位指点迷津。
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼2010-07-20 17:00:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手
★ ★
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-07-21 15:39:54
引用回帖:
Originally posted by shenlin0514 at 2010-07-21 11:27:04:

如果我有一个蛋白是经过定点突变得到的，具有突变点，请问如何构建3维模型呢？如何与野生型蛋白进行3维模型比较呢？

pymol 就具有这种功能啊~叠合一下就可以了~把突变的地方放大一点看就行~
赞一下(1人) 回复此楼
12楼2010-07-21 12:27:22
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 12 个回答

zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手
★ ★
wxf3454552(金币+1):谢谢参与
雪狼乖乖(金币+1):谢谢 2010-07-21 07:43:35
引用回帖:
Originally posted by wxf3454552 at 2010-07-20 17:00:35:
需要得到蛋白质三维结构 但是没有搜索到可用的同源模板  只知道一级序列
这种情况下应该怎么办？麻烦各位指点迷津。

改用thread法~这种方法适合同源性小于30%的模板，如果再小，可以尝试从头构建，上网找ROSETTA软件的在线版 ~这个可以在线构建模型~是华盛顿大学的~
赞一下(2人) 回复此楼
2楼2010-07-20 22:08:29
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tjegg

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★ ★
wxf3454552(金币+1):谢谢参与
lei0736(金币+2):谢谢 2010-07-21 09:21:40
给你一个网址，在上面试试。http://nihserver.mbi.ucla.edu/SAVS/

[ Last edited by tjegg on 2010-7-21 at 08:26 ]
赞一下(2人) 回复此楼
除了你的亲人，没有人应该对你好，对你好的人，一定要珍惜。
3楼2010-07-21 08:25:28
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手
引用回帖:
Originally posted by tjegg at 2010-07-21 08:25:28:
给你一个网址，在上面试试。http://nihserver.mbi.ucla.edu/SAVS/

[ Last edited by tjegg on 2010-7-21 at 08:26 ]

楼上给的这个网址不是蛋白质结构评价的网址吗？
赞一下 回复此楼
4楼2010-07-21 08:37:08
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 12 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复(可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭