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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】模拟初学者，虚心请教模拟水溶液中的存在形态，运动行为模拟软件的选择。
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thunder2009

木虫 (知名作家)

过河的卒子
★
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在风雨中寻找方向，从绝望中提取希望！
11楼2010-07-17 14:01:51
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zodlee

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by qasd at 2010-07-16 23:02:26:
基本可以，选择了一个正确的力场，基本就成功一大半了

呵呵，多谢Q大~~

另外。。另外。。。。

自己搜索总觉得云里雾里，用DS可行么？

DS对我最大的诱惑就是可以直接构建生理盐水体系...

我用MS构建水溶液都是。。

额。。。一个cell

1个XXX分子。。。299个水分子，等等等等..

有更快捷的方法么？
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12楼2010-07-17 18:12:21
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qasd

木虫 (著名写手)
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zzy870720z(金币+1):谢谢提示 2010-07-17 19:51:53
DS是为生物体系设计的，如果有合适力场的的话用DS是可以的，MS做药的比较少
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13楼2010-07-17 19:40:25
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zodlee

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by qasd at 2010-07-17 19:40:25:
DS是为生物体系设计的，如果有合适力场的的话用DS是可以的，MS做药的比较少

恩，确实，所以一直手头也找不到合适的文献

请问：构建水溶液只能是一个CELL里1个XX分子+299或XXX个水分子么？？
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14楼2010-07-18 14:34:18
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qasd

木虫 (著名写手)
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zzy870720z(金币+1):谢谢提示 2010-07-18 17:57:49
MS没有隐式水模型，只能这样
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15楼2010-07-18 17:57:24
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zodlee

银虫 (小有名气)
呵呵，我说我找了很多很多教程，怎么就是看不到之间建立水CELL的..

另外想问问Q大..

一般有机物和水分子的比例设定在多少会比较合适呢？
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16楼2010-07-19 09:59:10
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qasd

木虫 (著名写手)
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zzy870720z(金币+1):谢谢指点 2010-07-20 07:41:50
如果你是为了研究溶液中的构象的话，稀溶液较好，这个具体要根据你的计算能力和溶质分子大小来定。
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17楼2010-07-19 20:35:32
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luolingmm

金虫 (小有名气)

黄金铜虫
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想请问楼上，若是晶体生长动力学，该选MS的哪个模块比较好呢？
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一份耕耘一份收获
18楼2012-09-07 14:07:53
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乐天派的秘密

新虫 (正式写手)
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引用回帖:
17楼: Originally posted by qasd at 2010-07-19 20:35:32
如果你是为了研究溶液中的构象的话，稀溶液较好，这个具体要根据你的计算能力和溶质分子大小来定。

你好，我想请教一下MS中怎么建一个溶液的模型呢？刚开始用MS ，看得一头雾水的，希望能得到您的帮助，谢谢。
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19楼2017-12-18 21:26:13
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