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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 【求助】有没有dna库啊？
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574384607

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】有没有dna库啊？ 已有3人参与

大家好，我现在想用dna链，可以从哪里下到啊？就像蛋白质从pdb数据库里下一样，要是有的话，给发个链接过来吧
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1楼 2010-07-13 08:12:02
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zhuhongaaa

金虫 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-08-07 10:55:56
引用回帖:
Originally posted by 574384607 at 2010-08-06 21:11:49:

你好，dna我已经能尝试着建出来了
不过我还是有个小问题请教一下:
5‘和3’是什么意思？

这里红色标记的地方是什么意思，也需要输入吗 ...

DNA序列是有方向的，5’端是头，3‘端是尾。
打圈的地方，是指ATCG要用打圈的对应字母代替输入。今天晚些时候加你QQ详聊吧
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分子模拟的主页http://varmilion.tk/
13楼2010-08-07 10:21:08
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zhuhongaaa

金虫 (正式写手)
★ ★
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-07-16 18:06:53
574384607(金币+2): 2010-07-16 22:57:10
对于标准双链DNA，自己创建。特殊结构去PDB库或者NDB库
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分子模拟的主页http://varmilion.tk/
2楼2010-07-16 17:34:06
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574384607

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by zhuhongaaa at 2010-07-16 17:34:06:
对于标准双链DNA，自己创建。特殊结构去PDB库或者NDB库

我不是专门做到dna的，不过现在想建个体系，用到dna，要想获得一定碱基数（不用太多10-20个就可以），单链和双链的，一般可以通过哪些途径获得，或哪些软件网页生成哪？
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3楼2010-08-04 10:59:28
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zhixuec

木虫 (著名写手)
★ ★
lei0736(金币+2):谢谢 2010-08-04 14:42:10
DNA文库一般要自己构建的，或者你实验室已经构建过的，你可以直接拿过来用

不知道你是用于什么目的的，说的不是太清楚，你可以根据实验目的人工合成DNA双链
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酷爱の族
4楼2010-08-04 11:21:34
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