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whb8608105022

银虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】审稿人意见,没看懂,请教高手 已有2人参与

小弟投的晶体学报E,编辑给的修改回复,有两个没看懂,请教高手帮助!
问题一:Your molecule contains NO anomalous scatterers, i.e. atoms with Z>13.
So you can not refine the Flack parameter. Moreover, you have averaged the
Friedel pairs before the final refinement - and that is correct!
However, you should mention it in Experimental section.
As example:
_publ_section_exptl_refinement
;
...
Due to the absence of any significant
anomalous scatterers in the molecule, the ???? ( - how many ?) Friedel pairs
were merged before the final refinement.
;
Also you need to use the following lines in the CIF:
_refine_ls_abs_structure_details   ?
_refine_ls_abs_structure_Flack    ?
我除了按照他的要求在CIF里做出(_refine_ls_abs_structure_details   ?
_refine_ls_abs_structure_Flack    ?)这个修改外,还得在_publ_section_exptl_refinement补充上(???? Friedel pairs were merged before the final refinement.)但是我的原始数据已经丢失,这个数目已经无法算出,我该怎么办?能向编辑说明吗?还是不需要说啊。
第二问题:What about the positioning of hydroxy H atoms O2A and O3A.
Obviously, one of them has to be re-positioned to be involved
in intermolecular hydrogen bond proved by short intermolecular
distance O2...O3(*) of 2.752(4) \%A. So you will have one H atom
at the same position, and another - in a new position which allows
intermolecular O--H...O hydrogen bonding without Alerts A.
这个问题我没看懂他让我做啥,请教高手指路!
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whb8608105022

银虫 (初入文坛)

引用回帖:
Originally posted by whb8608105022 at 2010-07-12 13:18:36:
小弟投的晶体学报E,编辑给的修改回复,有两个没看懂,请教高手帮助!
问题一:Your molecule contains NO anomalous scatterers, i.e. atoms with Z>13.
So you can not refine the Flack parameter. Moreo ...

谢谢这位大哥
第一个问题我想算出那个数目,但是原始数据丢失,手头上是别人修改过一遍的数据,所以按照这个数据算出来,只有2个Friedel pairs 。会不会太少了?
第二个问题,我第一次提交时有A警报,退回后,我又重新修了一下,没有A警报才第二次提交的,所以,我猜测编辑的意思是问我那个氢修到哪去了还是别的啊?
再次感谢您的帮助!
4楼2010-07-12 23:09:57
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fmopily

铁杆木虫 (正式写手)

★ ★
whb8608105022(金币+1): 2010-07-12 23:10:29
yunruirui(金币+2):谢谢交流,希望常来。 2010-07-13 08:23:39
第一个问题编辑说的很清楚,并且你已经做过平均了,只是需要在cif的_publ_section_exptl_refinement中加入说明即可。
_publ_section_exptl_refinement
;
...
Due to the absence of any significant
anomalous scatterers in the molecule, the XXXX Friedel pairs
were merged before the final refinement.
;
同时cif中添加以下两行:
_refine_ls_abs_structure_details   ?
_refine_ls_abs_structure_Flack    ?

其中XXXX是一个数值,计算方法如下:
在ins里分别加merg2,merg3修一下,得到的两个Flack Parameter相减就是XXXX。

第二问题是有Alerts A,就是说O2A and O3A上的一个氢原子加得不对,你删除后重新加就可以了,家的时候一定要按照氢键的方向加,否则还会出错。
2楼2010-07-12 21:06:38
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fmopily

铁杆木虫 (正式写手)

yunruirui:谢谢交流,希望常来。 2010-07-13 08:23:54
原始数据已经丢失? 那你现在有哪些数据啊?
3楼2010-07-12 21:07:54
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fmopily

铁杆木虫 (正式写手)

2个Friedel pairs 可能不对
第二问题是O2A and O3A上的一个氢原子加得不对,你删除后重新加就可以了
5楼2010-07-14 14:36:38
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