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shuipan666

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】测序结果分析。。。都整半年了。。急急急急 急 已有7人参与

Sample Text克隆一个基因测序结果后,上下游都在,但是翻译后发现,有好几处都有终止密码子,测序几次结果都是这样。不知道咋回事。求高手指点。。涕零感激。。在线等待。。。

附上翻译部分截图

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shuipan666

银虫 (小有名气)

另外和其他物种比对之后也正确...
7楼2010-07-09 12:31:18
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xiadongliang

金虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
确定其实密码子是在第一个ATG哪儿吗?你的序列中有几个ATG呢。
2楼2010-07-09 09:36:28
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zemin_fang

木虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
需要找对正确的读码框,建议用ORF finder寻找后再blast分析,找到与你需要的序列相似性最高的结果分析
3楼2010-07-09 09:46:20
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jqq1985

银虫 (正式写手)


lstt09nk(金币+1):欢迎交流~~希望常来~~ 2010-07-09 10:00:22
你的第三个阅读框式可以通读的。但是不是ATG其实罢了。可能1:如果是原核那就是片段不完整,缺了前面一部分。可能2:这是真核的基因,里面有内含子。真核需要从RNA 来获得cDNA序列。
4楼2010-07-09 09:59:38
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