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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】如何分析mRNA结构
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小猫三两只

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】如何分析mRNA结构 已有1人参与

我现在克隆了一个基因的EST，1000bp左右，其它作物的同源基因全长一般也就1300-1500bp之间，通过3-RACE得到基因的3-端后，加上前面已经知道的部分5-末端，大概就是1300左右，所以现在就怀疑5-端可能就是现在的这个序列，不想再做5-RACE了，请问如何通过生物信息学的方法判断我现在的这个5-端就是基因的5-末端
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1楼 2010-07-06 11:52:01
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ben1147

木虫 (正式写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
看天(金币+1):鼓励交流 2010-07-06 12:05:54
和基因组序列比较一下

看看其他物种的这个基因mRNA的5'端和TATA-BOX的距离，再看看你这个基因的。
如果距离差不多，那就应该是了

如果有一定差，那就要看看到底是还没得到真正的5'端，还是5'-UTR里有内含子
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2楼2010-07-06 11:55:39
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