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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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fanta911

专家顾问

优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！

[交流] 【求助/交流】关于系统发育树，如何鉴定菌种 已有5人参与

小弟分到一些内生真菌，并测序对its序列用MEGA做了一个ME树，这个树包括我测序的真菌its序列和在genbank上比对的序列，基本我的菌种都能做到已知的属里面，但是，我要写文章，怎么分析我的序列是属于某一个种呢，差多少个碱基才能算做是同一个种呢？求高手指点，有没有很详细的文献
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1楼 2010-07-03 21:21:48
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fanta911

兑换贵宾

优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！
这方面的问题好多人提问啊，可惜一直没有高手来指点啊。请问虫友遇到过这种情况没，就是你测的菌株的ITS序列去genbank比对的时候，大部分有时候是不相关的uncultured fungi，这种情况怎么找到相关的菌株啊，有一个identity值，一般多少是可用的啊，多少可以订到属，多少可以定到科呢？
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10楼2010-07-12 10:17:35
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欣晴5832

超级版主

优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！
★
看天(金币+1):鼓励交流 2010-07-04 10:41:49
fanta911(金币+10): 2010-07-04 15:08:00
这个没有办法确定，有的时候即使是种内物种也会有个别碱基的差异，可以特别确定的只能说到属
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2楼2010-07-04 09:40:25
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xixi1619

兑换贵宾

优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！
你是不是做菌种资源的哦？这个基本的都不知道吗？
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3楼2010-07-06 16:26:50
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fanta911

主管区长

优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！
引用回帖:
Originally posted by xixi1619 at 2010-07-06 16:26:50:
你是不是做菌种资源的哦？这个基本的都不知道吗？

半路出家，不是很懂哦
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4楼2010-07-08 15:45:23
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